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原创 【利用perl的基因数据处理】复杂数据结构:矩阵 and Edit Distance Matrix

在perl语言中,没有对矩阵数据结构的的内设,在序列比对中,有很多矩阵的使用场景,比如编辑距离矩阵,匹配得分矩阵等,要使用perl语言表达这些矩阵,首先要进行矩阵数据结构的定义或者矩阵数据结构的表达;

2017-10-14 11:47:48 1214

原创 【利用perl的基因数据处理】1.基础的的DNA文件读写和碱基特征统计

我尚且处于生物信息学的小白状态,前两天刚学习了perl的基础语法,之后通过对“Begin Perl for  Bioinformatics ”书籍的学习,将生物信息学的基础数据处理和perl语言的编程有了基础的知识框架和应用了解。一下是在学习过程中对DNA的基本信息统计写的一串小代码,之后可能会将自己在学习过程中发现的一些实用小工具整合成pm包,方便以后使用:use strict;

2017-10-05 18:55:54 3208

原创 【python2.7初学日记】最初学习和编写的几个简单代码

Python语言在2017年作为最受欢迎的编程语言,又因为我对生物信息学比较感兴趣,作为生物信息学的语言基础,对其进行了一些简单的学习,在基础语法上,首先进行了一些感兴趣的编程的编写。写这系列博客的初衷只是作为在代码学习中的心得和日记记录。

2017-07-29 23:37:00 1232

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