- 博客(3)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 Conda的一些基础的操作
对于生信工作者，有一个方便可用的环境可以极大地方便我们开展分析，conda可以让我们在非root的情况下较为方便地切换不同的工作环境。对于conda的一些具体的介绍，可以从生信技能树的文章中学习。 我想写一个我自己觉得相对常用的一些知识，作为自己的总结。 传送门 阅读量过万的conda使用总结，跨越一年的更新 1 下载、安装、配置conda 对于日常工作来说，使用miniconda就足够，需要什么软件时再安装。由于国外的网络传输非常慢，我们可以从清华开源镜像网站下载。 目前已经更新到4.8.3版本，使用内置
2020-10-11 22:59:26
392
原创 SAM/BAM文件格式
SAM–Sequence Alignment/Map 文件格式 SAM文件是TAB制表符分隔的文件，BAM文件是其对应的二进制文件。主要分为两部分，刚开始是@开头的header行，里面包含有各种meta信息。接下来的是比对结果部分，每一行是有11列的比对信息，是我们最需要关注的部分。 各列所代表的信息(以下截图非特殊说明，都来自参考的pdf文件中) 第一列：QNAME-- Query template NAME这个很直白，就是query的片段的名称编号，对应测序fastq数据中reads的名称。 第二列
2020-10-01 20:41:10
597
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人