Galaxy 生信平台(四)：邮件与管理员配置

最新推荐文章于 2024-05-16 17:57:54 发布

BioIT爱好者

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文章标签： python java 大数据人工智能数据分析

本文链接：https://blog.csdn.net/bioitee/article/details/120798573

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前几天看到中山大学和国家基因库合作开发的 Translatome Workbench 翻译组学可视化在线数据分析平台 (db.cngb.org/galaxy/) 的推送信息，也上去看了一下，工具和教程都做的非常用心，这也算是国内为数不多的 Galaxy 研究中的一抹亮色了。

本文章作为 Galaxy 生信平台的第四篇，继续来带大家学习了解一下这个开源平台，希望大家有所收获。

我在《QQ 邮箱设置自定义域名邮箱》中给大家展示了，如何通过自己申请的域名+ QQ 邮箱打造一个高端大气的个人专业邮箱。今天来了一下如何把自定义的 QQ 域名邮箱应用到 Galaxy 生信分析平台中。

1. Galaxy 邮箱与管理员

Galaxy Project 是一个基于云计算背景下的开源生物信息分析项目，而 Galaxy 平台则是这个项目的集大成者。作为一个用于生产环境中，可以满足多用户使用的在线平台，Galaxy 的邮箱服务可谓是至关重要，尤其对于普通用户常见的登录限制、注册激活、密码重置与修改找回、页面错误报告等琐碎问题的处理上，它可以大大减轻系统管理员的工作量。

Galaxy 收发邮件的核心代码主要位于以下两个程序，其核心模块则是 util.send_mail，一个基于 email 和 smtplib 库进行封装的函数，具体源码，感兴趣的可以去研究一下。

lib/galaxy/util/init.py
lib/galaxy/managers/users.py
lib/galaxy/webapps/galaxy/controllers/user.py

所以，在设置 Galaxy 邮箱服务前，我们先来了解一下如何在 Python 中基于 email 和 smtplib 库进行 QQ 邮件的发送。

2. 基于 Python 的邮件收发

首先我们要知道用 python 代理登录 qq 邮箱发邮件，是需要更改自己 qq 邮箱设置的。在这里大家需要做两件事情：邮箱开启 SMTP 功能、获得授权码，步骤如下。

首先，在打开的 QQ 邮箱中，进入"设置"。

第二，在邮箱设置界面，打开 “帐户”。

第三，往下找到 POP3/IMAP/… 服务，点击 POP3/SMTP 所在行，右侧的 “开启”。

如果是第一次开启 POP3/SMTP 这时系统会要求通过密保手机发送一条特别内容的短信，待手机上短信发送完成后，点击 “我已发送”。

这样就可以得到 POP3/SMTP 服务的授权码了。

回到上页，可以看到 POP3/SMTP 服务已经处于开启状态。同样的，如果忘记了授权码，可以点击温馨提示中"生成授权码"的链接重新再次生成。

SMTP 服务和授权码都有了，接下来我们要基于 python3 的 email和 smtplib 库实现一个简单的发邮件功能。

from email.mime.text import MIMEText
from email.header import Header
from smtplib import SMTP_SSL

#qq 邮箱 smtp 服务器
host_server = 'smtp.qq.com'
#sender_login 为发件人的域名邮箱(或者 QQ 号码)
sender_login = 'shenweiyan@bioitee.com'
#pwd 为 qq 域名邮箱的授权码
pwd = 'r***h***b'
#发件人的邮箱
sender_mail = 'shenweiyan@bioitee.com'
#收件人邮箱
receiver_mail = 'ishenweiyan@gmail.com'
#邮件的正文内容
mail_content = '你好，我是沈维燕，现在在进行一项用 python 登录 qq 邮箱发邮件的测试'
#邮件标题
mail_title = '沈维燕的邮件'

#ssl登录
smtp = SMTP_SSL(host_server)
#set_debuglevel() 是用来调试的。参数值为 1 表示开启调试模式，参数值为 0 关闭调试模式
smtp.set_debuglevel(1)
smtp.ehlo(host_server)
smtp.login(sender_login, pwd)

msg = MIMEText(mail_content, "plain", 'utf-8')
msg["Subject"] = Header(mail_title, 'utf-8')
msg["From"] = sender_mail
msg["To"] = receiver_mail
smtp.sendmail(sender_mail, receiver, msg.as_string())
smtp.quit()

3. 配置 Galaxy 邮件服务

有了上一步 python 发送邮件的经验，接下来我们只需要修改一下 Galaxy 的主配置文件 config/galaxy.yml 即可：

galaxy:
    smtp_server: 'smtp.qq.com'
    smtp_username: 'shenweiyan@bioitee.com'
    smtp_password: 'h**z***j'
    smtp_ssl: true
    error_email_to: 'shenweiyan@bioitee.com'
    email_from: 'shenweiyan@bioitee.com'

配置完成后，重启 Galaxy 服务。

4. 管理员与强制登录

如果你只想把你个人部署的 Galaxy 提供给特定的人使用，例如同一个实验室的其他小伙伴，你可以把 Galaxy 的注册功能关闭，并设置只能通过管理员创建新账号。

galaxy:
    # 设置 Galaxy 管理员账号，如有多个管理员，请用逗号分隔
    admin_users: 'shenweiyan@bioitee.com'
    # 强制所有用户均需要注册登录才能使用
    require_login: false
    # 开启用户激活功能(如果设置为"false"，则帐户自注册以来一直处于活动状态)
    user_activation_on: true
    # 设置激活有效时长(小时)
    activation_grace_period: 3
    # 允许未注册的用户创建新帐户(否则，必须由管理员创建)
    allow_user_creation: false
    # 允许管理员删除已经注册的账号
    allow_user_deletion: true
    # 允许管理员模拟其他用户登录，进行问题追踪
    allow_user_impersonation: true

5. 一些测试

配置好了 Galaxy 邮箱服务，我们来测试一下注册激活验证和重置密码。

到这里，Galaxy 的邮件服务和管理员设置就完成了，如果想要更改 Galaxy 默认的邮件内容（例如把英文改成中文，或者增删邮件发送内容），可以仔细去研究一下它的源码，也欢迎留言或者添加作者微信交流。最后总结一句，就是，QQ 域名邮箱的本质还是 QQ 邮箱，因此，它收发邮箱的服务器设置依然是 qq.com，不管您最终选择 QQ 邮箱还是 QQ 域名邮箱，它们的配置原理都是一样。

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