不同物种的同一个基因的对应关系

biotrainee

于 2020-03-18 09:39:10 发布

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博客探讨了不同物种间的基因同源性，特别是在人类疾病研究中著名的TP53基因。作者通过脚本从特定数据库中提取信息，发现在物种间基因对应关系复杂，存在大量不明确的同源关系。文章提供了部分基因的分析示例，并提出了关于明确对应基因的富集分析及物种特异性基因的研究课题。

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我们都知道不同的物种在进化过程中其实共享很多基因的，尤其是哺乳动物，同一个基因虽然在不同的物种序列不完全一样，位于的染色体也不一样，发挥的功能可能也稍微有点区别，但是他们的相似性非常高！根据相似性就可以在不同的物种里面找到同一个基因。

比如在人类疾病研究领域非常出名的TP53基因，在人类参考基因组的17号染色体上面，但是在mouse里面不仅仅是改名了，叫做Trp53，而且位于11号染色体，在其它物种就更加多元化了。

所以通过研究生的辛辛苦苦查询文献，数据库，终于得到了下面这张表格：

mouse,	Trp53	Chr11	cM	Chr11:-(+)
human	TP53	Chr17	p13.1	Chr17:-(-)
chimpanzee	TP53	Chr17
macaque,rhesus	TP53	Chr16
dog,domestic	TP53	Chr5
cattle	TP53	Chr19	q15
rat	Tp53	Chr10	q24