数据分析
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甲基化分析,从IDAT文件到Beta values原创 2024-04-26 07:43:32 · 1158 阅读 · 0 评论 -
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数据分析:生存分析原理和应用实例
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数据分析:多种差异分析方法识别微生物标记物
三种差异分析方法筛选出来的物种(以lefse作为基准)的交集相对较多(高于50%)。三种差异方法,Maaslin2方法相对最严苛,筛选出的差异物种较少,而lefse和ANCOM-BC则筛选出较多物种。lefse没有考虑到多重检验校正,ANCOM-BC使用零膨胀以及校正样本间差异方法,这导致了更多差异物种被识别出来。需要注意点是,从后面单个物种的箱线图能看出,需要对物种出现率进行严格的过滤,可避免出现低出现率物种被识别出来(根据研究目的选择恰当的过滤参数)。原创 2024-02-06 18:20:01 · 1457 阅读 · 0 评论 -
数据分析:常用假设检验方法
显著性检验方法也即是假设检验方法。更多知识分享请到。一般假设检验方法使用需要根据三个条件判断:数据分组数目也即是处理组数目,以2为阈值;数据的分布是否符合正态分布,符合则选择参数检验方法,否则选择非参数检验方法;数据是否是配对数据。原创 2023-12-04 17:10:24 · 418 阅读 · 0 评论 -
数据分析:广义估计方程的基本介绍
广义估计方程的基本介绍原创 2023-08-16 11:42:13 · 1728 阅读 · 0 评论 -
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纵向数据统计方法,广义估计方程和混合线性模型原创 2023-08-11 17:16:13 · 2878 阅读 · 0 评论 -
数据分析:随机森林random forest在二分类中的应用
随机森林在二分类模型的应用原创 2023-07-26 17:43:00 · 3801 阅读 · 5 评论 -
数据分析:基于微生物species水平的机器学习分类模型
机器学习模型实战原创 2023-07-25 11:14:48 · 181 阅读 · 0 评论 -
数据分析:RNA-seq数据的批次校正方法
转录组数据多来源的批次效应校正方法总结原创 2023-07-20 09:59:50 · 3627 阅读 · 2 评论 -
数据分析:转录组差异分析总结(DESeq2+limma+edgeR+t-test/wilcox-test)
RNA-seq转录组的差异分析方法总结原创 2023-07-17 11:01:18 · 20507 阅读 · 2 评论