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百趣代谢组学党参远志散对记忆障碍大鼠学习能力和肠道菌群的影响
文章标题:Effects of Dangshen Yuanzhi Powder on learning ability and gut microflora in rats with memory disorde发表期刊:Journal of Ethnopharmacology影响因子:5.195作者单位:山西中医药大学百趣提供服务:粪便16S rRNA菌群测序分析百趣代谢组学分享-研究背景代谢组学分享,记忆障碍(Memory disorder, MD)是一种常见的临床症状,主要指由病理生理或情境原因产生的原创 2023-05-05 11:32:18 · 573 阅读 · 0 评论 -
外源6-BA在缓解多花黄精种子出苗过程中的代谢及转录组学变化
在6-BA处理解除黄精种子上胚轴休眠的过程中,与同一时期的对照组相比,前7天通过抑制类黄酮生物合成途径的基因和代谢产物来解除对芽分化的抑制,并促进生长素相关基因的表达,从而促进上胚轴芽的伸长。此外,在CTK生物合成途径中,参与黄精细胞分裂素脱氢酶基因(PcCKXs)在三个阶段都是活跃的,并与类黄酮、精氨酸和脯氨酸代谢途径代谢产物显著相关,其可能也影响黄精种子的休眠解除。总体而言,在前7天,参与玉米素合成途径的基因和代谢物普遍增加,28天后,相关基因和代谢物总体减少,并做了转录组信息验证(图4B–G)。原创 2023-04-14 10:40:57 · 790 阅读 · 0 评论 -
新品发布 | 单细胞转录组学
单细胞转录组学测序(Single cell RNA-seq):是对单个细胞的转录组进行研究的一项技术,其原理是将分离的单个细胞中微量的mRNA通过扩增后再进行高通量测序,主要用于研究异质性细胞的独特表型和生物学功能,有助于发现新的稀有细胞类型,深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。工作流程BIOTREE提供单细胞3'或5'转录组逆转录产物进行文库构建、以及BCR、TCR和VDJ文库构建、测序和分析,供老师根据关注的研究方向进行选择。Cell Barcode:标记不同的细胞;1000细胞双胞率低至0.3%;原创 2023-03-09 14:08:53 · 464 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享,膜脂代谢对桃果实冷藏过程中冷害的影响
文章标题:Membrane lipid metabolism influences chilling injury during cold storageof peach fruit发表期刊:Food Research International影响因子:7.425作者单位:浙江万里学院百趣提供服务:发现代谢组学Standard-亲脂版代谢组学分享-研究背景湖景桃果是一种果肉坚硬、保质期短的水果,对低温(LT)敏感,易发生冷害(CI)。代谢组学分享,本研究发现桃果实中的CI在4℃条件下,通过上调脂质基因表达原创 2023-03-06 14:10:59 · 447 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享,关于儿童Graves病相关的新环境物质的鉴定
代谢组学分享,其中黄酮、1-萘酚、对甲酚、紫荆叶素和5,6,7,8-四氢-2-萘甲酸的水平与TPOAb水平呈负相关,而呋喃妥因和反式-3-香豆素的水平与TPOAb水平呈正相关。由于碘是影响GD发病的主要环境因素,我们检测了GD患者的总碘水平,并采用逐步线性回归的方法排除了总碘对其他环境物质与甲状腺指标之间关系的影响。我们在GD组和对照组血清中检测了6种全氟化合物,但仅检测到全氟辛酸、全氟壬酸、全氟己烷磺酸和全氟辛烷磺酸盐在检测水平以内,剩余的全氟丁烷羧酸和全氟庚酸在血清中均在检测限以下。原创 2023-03-03 10:58:38 · 350 阅读 · 0 评论 -
代谢组学:Microbiome又一篇!绘制重症先天性心脏病新生儿肠道微生态全景图谱
肠球菌的过度生长通过代谢物介导CCHD的肠道屏障损伤和炎症反应,并与全身炎症和手术预后不良相关。在CCHD-P和CCHD-G之间共鉴定出19种鉴别细菌,其中14种富集于CCHD-P中,主要属于肠球菌属(图4B),推测肠球菌的过度生长是驱动CCHD-P和CCHD-G分离的一个关键微生物。与HC组相比,CCHD组有36种代谢物的上调和84种代谢物下调,主要涉及硫胺素代谢,亚油酸(LA)代谢,不饱和脂肪酸的生物合成,半乳糖代谢、苯丙氨酸代谢、酪氨酸代谢、花生四烯酸代谢和胆汁酸生物合成(图4)。原创 2023-03-02 14:04:03 · 554 阅读 · 0 评论 -
代谢组学揭秘弥勒珠芽魔芋多叶生长的相关因素-反式玉米素核苷浓度
代谢组学分享,在第二叶萌发期,本研究检测到的所有IPTs与非萌发期相比没有显著变化,但CYP735A1和CYP735A2的表达与非萌发期相比均显著上调,所有LOGs的表达与非萌发期相比虽均有所增加,但变化不显著。此外,iP处理对各组织中ABA含量的影响也是不一致的,iP处理显著降低了芽和根中的ABA含量,但显著提高了球茎中的ABA含量(图4B)。本研究测定了与叶萌发密切相关的植物激素水平,经分析发现,在第二叶萌发期,球茎中tZR的含量比休眠期增加了5000多倍,这可能是促进第二叶萌发的关键因素。原创 2023-02-28 10:18:03 · 427 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享—揭示水稻“生长-防御”平衡调控机制!
在本研究中,利用合江19号水稻突变体中的叶片(dwarf and narrowed leaf in Hejiang 19 mutant, dnl19)来确定OsCSLD4在水稻生长和防御之间发生的作用,揭示了OsCSLD4在调控水稻生长和防御之间的平衡中的分子机理。分析结果表明,dnl19中OsCSLD4的破坏导致L-缬氨酸、L-天冬酰胺、L-组氨酸、L-丙氨酸、龙胆酸的显著增加,但L-天冬氨酸、苹果酸、6-磷酸葡萄糖酸、6-磷酸葡萄糖、1-磷酸半乳糖、葡萄糖酸、D-天冬氨酸的显著减少。原创 2023-02-27 13:33:18 · 596 阅读 · 0 评论 -
人脑脊液的代谢组学研究—标识恶性神经胶质瘤的特征
代谢组学分享,作者将以上两种手段观察到的肿瘤大小与检测的代谢物关联起来,发现有8个代谢物与Tgad相关,10个代谢物与FLAIR相关(R2>0.50)。恶性神经胶质瘤CSF特有的代谢特征:采用无监督的分层聚类算法发现,胶质瘤病人CSF与对照组相比,其中代谢物水平有升高或降低(图1A)。有意思的是,新诊断的胶质瘤病人(1、2、5、7号)与其他样本不在同一分支。作者接下来分析了胶质瘤与正常样本存在差异的化合物,采用双侧t检验分析,39个化合物存在显著性差异(p原创 2023-02-24 15:08:27 · 539 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学-抑郁症居然“男女有别”,脑膜淋巴管起关键作用!
值得注意的是,在没有SCVS处理的情况下,VEGFR3d1-4单独治疗并不会影响非应激雄性小鼠在抑郁行为测试中的表现(图11a-d),这表明脑膜淋巴损伤本身不足以诱导雄性小鼠的抑郁行为,但会增加它们对应激的敏感性。代谢组学分享,此外,SCVS处理的雄性小鼠中,脑内注射过表达VEGFC的AAV并不会影响动物在抑郁和焦虑类行为测试中的表现,也不会影响体重的变化(图11i-q),这表明脑膜淋巴在调节抑郁和焦虑类行为中的作用存在“天花板效应”。代谢组学分享,据报道,这种模式会诱导女性产生抑郁症状,但在男性中没有。原创 2023-02-23 11:40:16 · 361 阅读 · 0 评论 -
阿趣课堂丨一作解读(IF 31.373) 三阴性乳腺癌铁死亡异质性的揭示
作为主要参与人员参与本中心TNBC代谢组学研究及关键分子探索,主要成果以第一作者及共同第一作者身份发表于Cell Research, Nature Communications, Clinical and Translational Medicine等国际知名杂志,第一/共同第一作者发表文章影响因子累计影响因子113分。铁死亡是一类近年发现的,区别于凋亡,不依赖caspase级联反应的调节性细胞死亡,机制层面上,铁死亡是铁依赖性的、由失调的脂质过氧化引起的、与代谢密切相关的调节性细胞死亡形式。原创 2023-02-22 13:18:15 · 208 阅读 · 0 评论 -
蛋白质组学技术与常见分析培训班火热招生中!
包括蛋白质的表达水平,翻译后修饰,蛋白与蛋白相互作用等研究内容,集中于动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定疾病、药物等对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制。专攻蛋白质组学领域,拥有近10年项目工作经验,服务过近百家医院,高校、研究所等科研单位,在蛋白质组学方案设计、实验流程、数据分析及蛋白质组学数据库应用等方向有丰富的项目经验。课后不用愁:课程结束后提供课程录播回放长期使用权,建立讲师学员沟通群,回复专业且及时,无障碍沟通,让您的培训学习之路更加便捷。蛋白质组学可应用领域。原创 2023-02-21 10:42:21 · 488 阅读 · 0 评论 -
代谢组+转录组分析为腰果树果实发育成熟过程中代谢网络提供见解
基于此,作者研究了参与蔗糖代谢途径的潜在的关键基因,在簇2的基因中检测到15个与蔗糖代谢和淀粉水解相关的关键基因(包括4个蔗糖双向转运蛋白基因(SWEETS)、2个转移酶基因(INVS)、3个蔗糖合成酶基因(SUSS)、1个果糖激酶基因(Frk)、1个己糖激酶基因(HXK)、1个蔗糖磷酸酶基因(SPP)和3个β-淀粉酶基因(BAM))。在“Nut”中,簇1的代谢物在整个果实发育过程中逐渐积累,簇2的代谢物在果实成熟后期富集,簇6的代谢物仅在发育早期有较高积累,簇2、簇3以及簇5的代谢物在发育中期积累较多。原创 2023-02-20 11:52:09 · 1453 阅读 · 0 评论 -
代谢组学资讯,全球爆火的ChatGPT,是如何看待三阴性乳腺癌的?
可以看到ChatGPT对比于以往的AI和搜索引擎直接展示的碎片化结果,ChatGPT对于问题的整理能力是强大的,它展示给我们是一个十分系统化的答案,但是并不能从中得到更为鲜明的观点。总的来说,经过本次与ChatGPT的对话,发觉它确实会提供一些写文章的思路和灵感,作为寻找思路和入门普及,有问题找ChatGPT是个不错的选择,但是想要进行深入解析具体文章的研究思路和技术手段还是需要运转我们人类充满智慧的大脑。研究热点:三阴性乳腺癌中铁毒性异质性的发现及其对于肿瘤抗肿瘤免疫疗法的组合策略提出了新的可能性。原创 2023-02-17 10:06:16 · 3258 阅读 · 0 评论 -
代谢组学分享-花青素通过调节氨基酸代谢改善糖尿病肾病的肾功能
为了确定肾脏和血清中ANT调控的靶向代谢物,本研究对CT、DKD和ANT组代谢物进行了STEM分析,并将样例1、5、6、9、10和14中的代谢物确定为趋势代谢物。图3. ANT对小鼠血清蛋白表达谱的影响通过DKD组和CT组的比较,发现血清和肾脏样本中共同检测到31个DEPs,包括已知的糖尿病相关蛋白,如Serpina3k、Lpl、C1qb、Lgals3、Ctsd、Pdgfra、Apoc3、Apoc1、Lifr和Igfbp2,而在ANT组和DKD组血清和肾脏样本中均检测到178个DEPs。原创 2023-02-15 11:12:25 · 621 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享,补充α-酮酸的低蛋白饮食对肾脏具有保护作用
因此,作者对5/6肾次全切除术(5/6Nx)诱导的CKD小鼠采用不同的喂养方法,探讨了LKD和LPD对肠道菌群和粪便代谢的影响。代谢组学分享,鉴于LPD存在潜在副作用,如氨基酸供应不足和营养不良,补充α-酮酸(一种必需氨基酸的无氮替代物)的LPD(LKD)被应用于延缓CKD的发展。作者将小鼠5/6肾切除后给予正常蛋白饲料(NPD)组、低蛋白饲料(LPD)组和低蛋白饲料加α-酮酸(LKD)组,8周后,采集血液、肾组织和粪便进行生化分析、组织学、肠道菌群的16S rRNA序列和非靶标粪便代谢分析。原创 2023-02-13 11:39:11 · 671 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学资讯:槟榔的基因组为雌雄同株植物的性别决定提供见解
通过ATAC-seq检测发现,在MF(雌花)和FF(雄花)中,可及性区域(ACR)的基因的表达水平都显著高于没有ACR的基因(图2a、b),在ATAC-seq检测到的peak中,超过60%位于远端基因间区域,近端ACR相关基因的表达水平显著高于远端ACR相关基因(图2c)。在花序发育过程中,P4中IPA和tZR的浓度显著高于P1和P2的浓度,P1和P2的IP浓度与P4无显著差异(图4b),P4中茉莉酮酸(JA)和茉莉酮酰-异亮氨酸(JA-Ile)浓度较高(图4c)。文章标题:The genome of。原创 2023-02-10 14:28:50 · 780 阅读 · 0 评论 -
代谢组学Nature子刊!抑郁症居然“男女有别”,脑膜淋巴管起关键作用!
代谢组学文献分享,另外,还发现几个编码胶原蛋白的基因,包括Col6a1,Col1a2,ndCol3a1以及编码处理胶原蛋白的基质金属蛋白酶Mmp23的基因,在应激和衰老中显著下调,这表明与细胞外基质的分离可能是介导脑膜淋巴变性的关键因素(图14k)。代谢组学文献分享,此外,SCVS处理的雄性小鼠中,脑内注射过表达VEGFC的AAV并不会影响动物在抑郁和焦虑类行为测试中的表现,也不会影响体重的变化(图11i-q),这表明脑膜淋巴在调节抑郁和焦虑类行为中的作用存在“天花板效应”。原创 2023-02-09 15:05:34 · 445 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:“4K”微生态助力结直肠癌临床诊断研究
为进一步探索微生物介导的功能变化,基于KEGG进行KO和pathway水平的功能分析,发现了1,053个差异KO基因和49个差异pathways,与碳水化合物代谢相关的pathways(如:丁酸,抗坏血酸和醛酸代谢)和与氨基酸代谢相关的pathways(D-精氨酸和D-鸟氨酸代谢)在CRC中升高,支链氨基酸和脂质代谢相关的pathways在CRC中减低;近年来,生活方式和环境因素对肠道菌群影响的研究被不断报道,且发现了肠道菌群在CRC中的改变,但是功能方面的研究仍缺乏,也没有基于“多界”微生态的系统研究。原创 2023-02-08 11:00:49 · 515 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享:基于大规模多中心人群的肝癌血清标志物研究
代谢组学文献分享,另外测试集的数据也显示,在区分小肝细胞癌和肝硬化的时候,该标志物组相对于AFP有较高的诊断敏感度和相似的诊断特异性。这项研究从多个中心招募了1448名受试者,对这些样本进行代谢组学LC-MS/MS检测,并结合多变量和单变量的统计分析,鉴定验证到了一组生物标志物:phe-trp和GCA,能够显著提升HCC的诊断敏感度和特异性。标志物组的敏感度能达到80%-70.3%,并且从3年前到1年前的数据可以看到,它对临床前HCC的诊断的敏感性是持上升趋势的。S-HCC:小肝细胞癌;原创 2023-02-07 10:50:45 · 758 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享,组学联合分析阐述玉米自噬的影响
代谢组学文献分享,在植物中,主要的自噬途径由一系列自噬相关(AUTOPHAGY-RELATED,ATG)蛋白质介导,作者将野生型玉米(WT)和敲除核心自噬组分ATG12的突变体(atg12-1:完全敲除,atg12-2:中度敲除)在富氮(+N:15 mM)条件下培养2周,之后一部分继续培养,剩余的转至氮缺乏(-N:0.1mM)条件下培养,一周后取第二片和第四片叶进行各组学检测,代谢组和离子组分别设置5个重复,转录组和蛋白组分别设置3个,每个重复由5片相似的叶片混合而成。d.氮的有效性影响叶片的发育。原创 2023-02-06 11:09:51 · 430 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:OnPLS方法在哮喘领域应用研究
红色:临床差异信息,灰色:转录组学差异信息,绿色:代谢组学差异信息,黄色:差异鞘脂类,蓝色:差异脂肪酸,橙色:差异氧化脂类,数字:连接度,黄色连线:正相关,紫色连线:负相关,蓝色节点:含量在哮喘病人中上升,红色节点:含量哮喘病人中下降。红色:临床差异信息,灰色:转录组学差异信息,绿色:代谢组学差异信息,黄色:差异鞘脂类,橙色:差异氧化脂类,数字:连接度,黄色连线:正相关,紫色连线:负相关,白色节点:含量在女性组中上升,黑色节点:含量男性组中上升。原创 2023-02-03 13:14:13 · 417 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享埃博拉病毒发病机制及组合生物标志物的发现
代谢组学文献分享,对患者的血浆样本和外周血单个核细胞(PBMCs)进行了基于代谢组学、脂质组学、蛋白组学等的多组学分析,以研究不同患者对埃博拉病毒反应存在差异的机制,并寻找感染EVD死亡病例的生物标志物。由于此前对于埃博拉病毒导致宿主的代谢反应知之甚少,作者先进行了代谢组学的分析,通过代谢组学的检测发现的最明显的一个现象是EVD致死患者血浆中游离氨基酸的含量下降的非常显著,说明在EVD致死患者体内免疫细胞被激活了,同时蔗糖的含量显著上升,可能是由于EVD导致的肠组织损伤使蔗糖无法被分解而导致的积累。原创 2023-02-02 11:29:00 · 376 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:大麦盐胁迫响应机制的组学分析
研究发现,大麦植株表现出一种有趣的胁迫响应策略—“以不变应万变”:耐盐植株茎内金属离子浓度及代谢途径在盐胁迫过程中的变化显著小于盐敏感植株。代谢组学文献分享,一种可能的解释是:高耐盐植株进行了更加高效的应激调节,避免了过度调控导致的能量浪费,从而可维持稳定的生长状态。代谢组学文献分享,浙江大学吴德志教授研究组最近发表的研究成果比较了耐盐能力不同的两种大麦植株在盐胁迫条件下的生长情况,并综合考察了离子组、代谢组和蛋白组信息。因此开发耐盐农作物并研究其耐盐机制具有迫在眉睫的重要意义。原创 2023-02-01 11:51:08 · 463 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享Lip-SMap:绘制代谢物和蛋白相互作用图谱的新方法
代谢组学文献分享,由于代谢物与蛋白的特异性结合会引起蛋白结构的局部改变,从而改变蛋白质被PK酶切的表位产生不同的肽组,通过与对照组的比较筛选出代谢物与蛋白的作用图谱,从而找出结合位点。该团队又选取几个参与中心碳代谢的代谢物与酶(柠檬酸与磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶Ppc,果糖-1,6-二磷酸FBP与磷酸烯醇式丙酮酸合酶调控蛋白PpsR, FBP与果糖-6-磷酸脱氢酶)的相互作用进行研究,发现代谢物通过间接的方式调控酶的变构从而调节酶的活性(图3B,C)。同时也揭示代谢物与蛋白的结合会引起蛋白高级结构的变化。原创 2023-01-31 11:22:00 · 1381 阅读 · 0 评论 -
代谢组学文献解读:高胆固醇饮食与脂肪肝相关肝癌的关系
代谢组学文献分享,对HFHC组小鼠喂食降胆固醇药物阿托伐他汀(Atorvastatin)进行治疗,在试验结束时,阻止了HFHC诱导的NAFLD-HCC形成,并且改善了NASH的严重程度,同时血清胆固醇、肝游离胆固醇、血清甲胎蛋白(AFP)也显著降低。代谢组学文献分享,同时,对小鼠粪便进行了16S rRNA测序、血清进行代谢组分析,结果表明高胆固醇饮食会引起肠道菌群失调及微生物色氨酸代谢受损,并诱导NAFLD-HCC的形成。2.代谢组学文献分享,在NAFLD-HCC小鼠中发现了肠道菌群及其相关的代谢物改变。原创 2023-01-30 10:50:22 · 470 阅读 · 0 评论 -
结合代谢组学和网络药理学研究康复消炎栓治疗慢性盆腔炎作用机制
总体而言,我们推测KFXYS的成分可能作用于关键蛋白质,包括ARG1,NOS2,NOS3等,以在CPID的治疗中发挥作用(图9)。代谢组学分享,通过开发实时二元比较的方法,以鉴定吸收到血液中的KFXYS的成分(图3),共鉴定出60种KFXYS衍生化合物,包括10种原型化合物(表1)和50种代谢物。代谢组学分享,根据具有良好AMDE行为、9个关键靶点和2个关键代谢途径的成分,构建了KFXYS在治疗CPID中的“中药处方-单药-化合物-关键靶点-关键途径-疾病”网络(图8)。前10个通路如图7C所示。原创 2023-01-29 16:51:31 · 541 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:以猪为模型检测哺乳动物之间的代谢物交换
代谢组学文献分享,对禁食过夜的成年猪(50公斤)进行了短暂麻醉,并从动脉循环和特定器官的引流静脉中抽血,每根血管抽取血液2次,分别独立提取血清样品,用液相色谱-质谱法(LC-MS)测定3次,计算了引流静脉(Cv)相对于全身动脉血(Ca)的代谢物丰度的对数比, log2(Cv/Ca)大于0表示净释放,小于0表示净吸收,其中,在猪血清中检测到280种代谢产物(图1E),其中91%的代谢产物对至少一个器官的AV差异具有统计学意义(图1E和1F)。因此,肾脏可以氧化乳酸为丙酮酸,从而有助于循环氧化还原稳态。原创 2023-01-28 11:44:55 · 679 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:间歇性禁食调节糖尿病脑损伤多组学研究
最后,为验证IPA和短链脂肪酸这些微生物来源的代谢物尤其是5-HT和TUDCA在认知缺陷中的作用,对db/db小鼠喂食干预这些代谢物一段时间,代谢组学文献分享,结果发现,db/db小鼠的认知功能和胰岛敏感性均得到改善,同时线粒体生物合成功能得到提升。最后,将与IF相关的36个hub基因、17个OTUs和26个代谢物(包括23个与肠道菌群相关的代谢物和3个短链脂肪酸)进行关联分析,发现彼此相关性都较高的标志物(乳酸菌、拟杆菌、胆汁酸、IPA、5-HT、线粒体和核糖体相关的GO等)。整个文章研究思路清晰,以。原创 2023-01-13 11:13:36 · 581 阅读 · 0 评论 -
高通量代谢组学四路筛选法,揭秘“神药”二甲双胍延长寿命的机制
通过外源性补充进一步研究胍丁胺的作用,胍丁胺延缓了蠕虫的发育和生殖输出,上调了Pacs-2::GFP的表达(图3B),并延长了寿命(图3C)。正如预测的,从(图1A)中可以看出二甲双胍削弱了细菌生长的能力,延长宿主寿命(图1B), Pacs-2::GFP表达增加(图1C),随着二甲双胍浓度的增加而显著变化。代谢组学文献分享,研究发现二甲双胍能够上调脂质代谢相关基因(图5A),特异性降低脂滴的大小和丰度(图5B),同时能够增加大肠杆菌OP50上饲养的蠕虫的过氧化物酶的丰富度(图5C)。原创 2023-01-11 14:02:28 · 513 阅读 · 0 评论 -
组学新品|“4K”微生态之肠道菌群深度宏基因组
在这个轴内,不同的微生物能够通过代谢影响胆汁酸、维生素、氧化三甲胺、短链脂肪酸、神经递质等物质的合成及分解,进而影响机体的多器官功能运行,比如调控炎症因子如肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)、转化生长因子-β(TGF-β)和抗炎症因子如白介素-10(IL-10)、白介素-1Ra(IL-1Ra)来调节机体免疫功能,从而在宿主疾病的发生、发展、预后、预防和预警过程中具有重要的作用。与之对应,微生物群可以分为病毒群、细菌群、古细菌群和真核细胞型微生物群。原创 2023-01-10 11:06:01 · 346 阅读 · 0 评论 -
代谢组学喜讯|百趣生物与金域医学达成代谢组学战略合作
百趣生物的创始团队来自于复旦大学、中国科学院等知名高校,深耕代谢组学技术十多年,立足上海,放眼全球,依托上万平方米的研发、生产、服务基地,建立了完善的非靶标代谢组学、高通量靶标代谢组学、脂质组学、代谢流、蛋白质组学、单细胞组学、抗体测序等检测分析平台,开创了国内代谢组学科研服务市场的先河。百趣生物正好专注于代谢组学科研服务和临床转化这两方面,希望今后百趣生物可以充分发挥核心专长,与金域医学优势互补,共同打造‘医检+’生态圈,为临床提供领先的代谢组学科研和医检服务而努力,进一步推动临床的发展。原创 2023-01-09 11:20:44 · 552 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享:黑木耳多糖对小鼠肠道微生物及代谢表型的影响
与ND组相比,AAP组拟杆菌、放线菌和变形菌的丰度显著增加,而厚壁菌门的丰度显著降低。随后通过组间学生t检验,发现几种具有显著差异(p原创 2023-01-06 13:29:11 · 621 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:学科交叉研究,微生物回收重金属机制研究
1657和1536 cm-1,这与蛋白质的酰胺I和酰胺II振动相关,1400和1241 cm-1处,-与νs(-OCO)和ν(C-O)分别在蛋白质中细胞色素c的拉伸振动有关,两个细胞之间的唯一区别是,在Pd(II)离子减少后,SgZ-5T的中心区域以1400 cm-1为中心被分成两个带(1412和1384 cm-1)(图3B中的顶部插图))。Fig.2.市售的Pd / C和生物合成的Pd,Pd 3d核外电子层(A,B),C 1s核外电子层(C)和O 1s核外电子层(D)的XPS光谱。原创 2023-01-05 14:56:25 · 456 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享:从SWATH到MRM:一种新型高覆盖度靶向代谢组学技术
统计629个代谢物在两组相邻稀释梯度间检出强度比值(4×:16×、16×:64×,log2(理论值)=2),结果表明SWATHtoMRM > SWATH-MS¹> SWATH-MS²,SWATHtoMRM技术在不同的稀释梯度组合中具有接近的中位值以及较窄的分布,同时SWATH-MS¹也是优于SWATH-MS²的,SWATH-MS²在16×:64×组合中,比值中位数已经严重偏离了理论值(4倍),并且具有很宽的分布范围(图4e)。(c)R²累积分布,从R²=1到R²=0.8,满足条件的代谢物数目逐渐增多。原创 2023-01-04 10:52:00 · 874 阅读 · 0 评论 -
喜讯 | 代谢组学领航企业百趣生物完成数千万元A+轮融资!
在此背景下,百趣生物十年如一日,长期致力于对生物样本进行代谢组学、蛋白质组学等多组学技术研究和应用,并将研究成果转化成可应用于临床的早筛和诊断的创新产品,从而减少人类因疾病而产生的痛苦,提升生命的质量。百趣生物的创始团队来自于复旦大学、中国科学院等知名高校,深耕代谢组学技术十多年,立足上海,放眼全球,依托上万平方米的研发、生产、服务基地,建立了完善的非靶标代谢组学、高通量靶标代谢组学、脂质组学、代谢流、蛋白质组学、单细胞组学、抗体测序等检测分析平台,开创了国内代谢组学科研服务市场的先河。原创 2023-01-03 09:40:39 · 476 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学文献分享:《Food & Function》发表过的封面文章
与对照组大鼠相比,摄入HEP的大鼠以下21种代谢物含量较高:2,4-二羟基苯甲酸、20-羟基二十碳四烯酸、高香草酸、二十二碳五烯酸、苯氧乙酸、N-苯乙酰甘氨酸、果糖6-磷酸、十七烷酸、脱落酸、胆酸、癸二酸、香草醛、异油酸、酪氨酸、长叶薄荷酮、甲硫氨酸、4-O-甲基戊酸、丙酰基-L-肉碱、胞嘧啶、吲哚-3-乙酸、烟酰胺;代谢组学分享,例如,所有多酚(2,4-二羟基苯甲酸、高香草酸、苯氧乙酸、4-O-甲基戊酸)与GSH-Px呈正相关,与Cu2 +呈负相关,与ORAC呈正相关。:处理组、对照组(n=8)原创 2022-12-30 15:36:22 · 1099 阅读 · 0 评论 -
国自然研究热点之组学在临床疾病的应用②
国自然研究热点之组学在临床疾病的应用②。原创 2022-12-29 10:17:42 · 168 阅读 · 0 评论 -
关于两种单菌种发酵的豆瓣酱代谢组学方面差异研究
且在两菌株的发酵体系中发现了不同的醇类。GQ1-3中谷氨酰胺的相对含量较高,而HGPA20中天冬氨酸和天冬酰胺的相对含量较高,说明两株发酵的豆瓣酱中鲜味物质的组成存在差异。代谢组学分享,因此推测,两株菌株中氨基酸的主要合成途径不同,在GQ1-3中,α -酮戊二酸衍生型(谷氨酸型)的氨基酸合成占优势,而在HGPA20中草酰乙酸衍生型(天冬氨酸型)的占优势。代谢组学分享,发酵开始时,HGPA20体系的AAN含量高于GQ1-3,但在发酵第40天同时达到最大值,GQ1-3的豆瓣酱发酵速度要快于HGPA20。原创 2022-12-28 13:44:56 · 707 阅读 · 0 评论 -
百趣代谢组学分享:针灸改善乳腺癌相关性疲劳!非靶代谢组学…
随后作者进一步筛选出8种主要的差异代谢物,针灸组血清中红藻胶、N-甲基烟酰胺、4-羟基-1吲哚-3-乙腈、β-甘油磷酸、乙酸香叶酯、氧化苯乙烯、5-羟色胺和乙酰肾上腺素的水平高于模型组和假针灸组,这些主要差异代谢物在对照组中也高度表达(图6J)。代谢组学分享,另外,与对照组相比,CRF显著提高了肠道(图4C、D)和海马(图4E、F)中促炎因子IL-1β、IL-6和TNF-α的蛋白表达水平,并且三种促炎因子水平在针灸治疗后均被显著抑制(图4C-F)。(4)Sham组,在相应治疗点附近的非穴位刺激小鼠。原创 2022-12-26 14:29:38 · 814 阅读 · 0 评论
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