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RSS订阅原创 山大生信_02_序列比较_P1
目录第三章：序列比较（第一部分）课时3.1 认识序列3.2 序列相似性3.3 替换记分矩阵3.4 序列两两比较：打点法3.5 序列两两比较：序列比对法3.6 一致度和相似度第三章：序列比较（第二部分）课时3.7 在线双序列比对工具3.8 BLAST搜索第三章：序列比较（第三部分）课时3.9 多序列比对介绍3.10 在线多序列比对工具3.11 多序列比对的编辑和发布...
2020-05-11 15:10:22
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原创 化学生物学_06
NAD是生物学专有名词，一种酶的英文简称，在生物制药领域有重要作用即烟酰胺腺嘌呤二核苷酸。是一种转递电子 ，是体内很多脱氢酶的辅酶，连接三羧酸循环和呼吸链，其功能是将代谢过程中脱下来的氢传递给黄素蛋白。NADH或更准确NADH+，H+是它的还原形式它可以被还原，最多携带两个电子 (写为 NADH+H+)NAD 于1904年发现其他有名的衰老基因还有：daf2、daf16（下游激活FOXO抗...
2020-03-26 18:59:47
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原创 化学生物学进展_04
为什么关注的是Proteome和Phosphoproteome,仅仅关注一个基因和蛋白类似盲人摸象，所以更关注整个系统的研究而非单个的蛋白和基因能够用质谱检测的probechemical reporter（analogies糖、lipid 叠氮 炔基和wt分子长得很象，和wt在细胞中的behavior一样）–根据化学反应–缺点：质谱仪测如果用amino acid做analogies，最好...
2020-03-12 18:45:48
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原创 化学生物进展_03
1.检测PTM的位点的work flow：Bottom-up and Top-down液相色谱质谱连用系统LC-MS–搜库–protein ID问题：trypsin酶切，为什么用二级质谱搜索，测到多少个修饰？以前电离时能量太高，蛋白碎成碎片了所以直到1900+才应用到检测peptide445.12 445.62处有2架的分子每一个peptide是由一组peak构成的分析s...
2020-03-05 18:38:18
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原创 化学生物学进展_02
蛋白在细胞内的平均寿命：最多可达数天，血红蛋白可存在长达3月，测血糖测的是糖化血红蛋白；平均寿命是7-8h，histone存在时间长，而转录因子存在时间短。同一个基因coding的protein的form多种多样，不同状态下有不同的form。不同的form如何产生：调控举例：氧化-不稳定泛素化-degradation甲基化和乙酰化修饰acetylationsignal...
2020-02-27 18:35:10
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空空如也
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