AI4S - 蛋白质完整序列(长) 查找 PDB 结构序列(短) 教程

本文详细探讨了DiffDock这一创新技术,它在软件开发中用于比较和合并代码文件。通过DiffDock,开发者可以高效地识别并解决代码冲突,提升团队协作效率。此外,文章还介绍了其工作原理、主要功能以及如何集成到日常开发流程中。

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在蛋白质结构预测的过程中,输入一般是蛋白质序列(长序列),预测出 PDB 三维结构,再和 Ground Truth 的 PDB 进行比较,GT 的 PDB 是实验测出,比真实的蛋白质序列要短,需要使用算法进行查找。

满足约束:PDB 结构序列的长度 小于 蛋白质序列的长度,并且是子集关系。

  • 黄色是 PDB 官网的结构
  • 蓝色是预测的全长序列的结构
  • 粉色是通过算法,截取的子结构

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