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原创 单细胞专题(二)| 我们的生老病死,被“它”看得透透的

在上一篇肿瘤疾病专题中提到(小伙伴们在文末可查看对应链接),若把细胞类型鉴定是单细胞测序的“看家本领”,那么区分细胞发育特征、重构它们之间的分化路径,就是单细胞转录组(scRNA-seq)的另一项重要应用。单细胞转录组测序技术可以帮助揭示机体细胞功能和分子调控机制,改变了人们对独特细胞类型和信号通路的理解,对于机体的生长发育和疾病研究有着重要作用。具体来说,scRNA-seq在生长发育研究中的应用方向大致可以包括:胚胎发育、组织/器官分化、衰老死亡等等。接下来跟着小编通过几篇高分文章走进单细胞在生长发育

2021-03-01 14:26:55 174

原创 单细胞专题(三) | 科普界《工作细胞》又A又飒,但科研圈宠儿还得是它!

科普动漫《工作细胞》要更新啦!在科研界兢兢业业打工的小美,面对如此科普生命科学的动漫清流,必须要极力向小伙伴们推荐。。。其中关于免疫系统的知识点,也强烈建议大家多多了解~而其中非常重要的免疫系统各种细胞们,则是守卫人体世界和平的最给力的战士。《细胞工厂》告诉我们,科普也能又潮又飒。殊不知,在学术界,对我们的免疫系统的研究也有一个又潮又飒的方法已是炙手可热,那就是单细胞转录组(scRNA-seq)。目前免疫系统scRNA-seq研究方向大致包括免疫细胞发育、分子免疫机制和免疫性疾病等。**01 免疫

2021-02-24 11:28:08 686

原创 互作转录组常用数据库介绍

互作转录组可研究两个物种或多个物种的相互作用机制,也就是说利用该研究方法,我们不仅可以得到宿主防御病原菌机制,也可以研究病原菌如何侵染宿主。关于病原菌如何导致宿主患病和宿主如何防御病原菌入侵,一直以来就是生物学研究的重要内容,因此在很长的研究历程中,就有了各种宿主病原体相关的数据库,本次就为大家介绍一下研究中可能会用到的数据库。1.TOP1(强烈推荐) PHI-base1、PHI-basehttp://www.phi-base.org/该数据库收录的主要是被实验证实具有毒力和效应基因的细菌、卵菌、真菌

2020-09-18 15:37:30 2021

转载 转录组测序之各类样品如何取样保存

我们将常见转录组测序的样品分为五大类:植物、动物、血液、微生物和互作类型,不同的类型对于取样方法和要求不尽一致,下面就一一介绍一下。植物组织:植物组织一般要求重量大于 4g。首先我们要准备好液氮预冷的无酶管,并做好取样器械的消毒和去RNA酶处理,尽量选取新鲜幼嫩、生长旺盛部位的样本进行迅速采集,然后用RNase-free水对样品表面进行快速的清洗,吸干表面液体之后放入无酶管中液氮速冻(时间不要太短哦),待彻底冷冻后,转移至-80℃冰箱保存。动物组织:送样的重量一般要求在 2g以上。若在实验室中取

2020-09-07 14:55:46 7995

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