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原创 infercnv中rjags或jags包安装问题及解决办法(windows演示)

通过解析报错发现,它似乎提到"rjags is only an interface" ,引导你去下载JAGS,这个故事告诉我们rjags只是R语言的一直表面引导方式,真正的。MAC和LINUX下载rjags和infercnv坑比较少,前者可以brew install jags(我本人没试过),当然也可以用本文的方法。当选择第一个 install for anyone using this computer的时候,其会默认装在。注意R语言中的斜杠 \ 和windows中的 / 是相反的!

2023-11-19 11:42:23 7411 10

原创 服务器单细胞安装RJAGS失败

其实是应该通过APT下载,直接在终端输入即可。

2023-11-18 16:15:20 422 1

原创 Bioconductor version cannot be validated; no internet connection 解决方案

我在服务器中安装的双系统中登录windows,机缘巧合连上了别人的大学网络账号,windows下 R studio竟然完美安装 Bioconductor?因此猜测是否是网络本身很慢,导致Bioconductor连不上,而Bioconductor没有问题。原来不一定是学校防火墙的问题,而可能是“学校网络本身”的问题,但本校校园文还是比较稳定的呀?的确是很有道理,因为校园网的防火墙通常是学校设置的,可能真的会影响Bioconductor。然鹅本人并没有动过这些设置,努力关掉他们,系统提示“你没有设过啊?

2023-11-18 10:37:28 3190 1

原创 单细胞read10x matrix.mtx无法读取(win11)

Cellranger 2.0生成的是matrix.mtx, 没有.gz压缩文件后缀。2. 不放心可以重新解压,此生再也不会出现Matrix.mtx变成matrix.mtx.txt读不出的情况了。但是却有时读不进matrix.mtx(expecting matrix?貌似正常的matrix.mtx,实际内涵玄机,如果在“属性”,详细信息中可能会看到,其。不是如下的matrix.mtx,而可能自动代入了matrix.mtx.txt文件。其实人家已经是matrix.mtx.txt了捏,怎么找嘛。

2023-11-09 12:02:19 1339 2

空空如也

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