浪费时间:48h
首先在安装bioconductor过程中会报错“time out of 60s”
其次,在使用Bioconductor::install中会发生“Bioconductor version cannot be validated; no internet connection?”错误
在无数次查找github和bioconductor后都一无所获,提示的几个操作都没有用
后来不经意间发现
R studio server 调取 CRAN相比一般的电脑慢很多很多
这个界面通常需要卡10分钟才出现
因此猜测是否是网络本身很慢,导致Bioconductor连不上,而Bioconductor没有问题。
又前往Bioconductor查询,有提到需要查看系统防火墙/proxy代理
的确是很有道理,因为校园网的防火墙通常是学校设置的,可能真的会影响Bioconductor
然鹅本人并没有动过这些设置,努力关掉他们,系统提示“你没有设过啊?”摸不到头脑。
事情的转机出现在:我在服务器中安装的双系统中登录windows,机缘巧合连上了别人的大学网络账号,windows下 R studio竟然完美安装 Bioconductor ?? Amazing
原来不一定是学校防火墙的问题,而可能是“学校网络本身”的问题,但本校校园文还是比较稳定的呀?
神奇?Bioconductor竟然装上了
此时切换回服务器LINUX,发现Bioconductor又可以了???
目前得到的结论是
1. 如果学校服务器有线网需要用账户登录,则不应该和“控制服务器的电脑”使用同一个账户登录
其原因可能是对同一个使用者的网络流量或可连机数有一定限制
检索github和Bioconductor官网,相关链接如下
I can't download BiocManager but has been download · Issue #178 · Bioconductor/BiocManager · GitHub