磁共振实验数据SPM8处理流程(继续)

这篇博客详细介绍了SPM8软件在磁共振实验数据预处理中的头动校正步骤,包括Realignment、Coregister、Segment和Normalize过程。通过头动校正来矫正实验过程中的轻微头动,确保数据质量。后续步骤涉及结构像与功能像的配准、分割和标准化,以实现不同被试数据的统一和标准化。最后,通过Smooth进行数据平滑处理,预处理流程至此完成。
摘要由CSDN通过智能技术生成

继续上一次的话题,做完了Slice Timing,接下来就该进行头动校正了。

2、Realignment 头动校正

        即使我们对被试的头部做了很好的固定,在实验过程中,被试也会不由自主的有一些轻微的头动,这在fMRI实验中尤为明显。这一步就是把一个实验序列中的每一帧图像都和这个序列的第一帧图像按照一定的算法做对齐,以矫正头动。

        目的:如果在容许的头动范围内,可以使用一定的算法校正信号,使其靠近真实值,如果超过了这个规定的范围,则必须剔除这组数据。

        头动范围(Check Realign):  平动≤2.0mm and 旋转≤2.0degree[严老师观点]

        我们在预处理面板校准选项中选择“Realign(Est&Res)”,出现一个参数设置对话框。

修改其中参数:

Data:New:Session

然后选中data下出现的“Session”选项。点击“Specify Files”,用spm文件选择器选择刚做完时间校准的全部图像(a*.img)。

Filename Prefix:默认为r

其余选项采用默认设置,点击上方绿色的三角开始运行。

        做完这一步,能给出该序列中被试的头动情况,以作为是否放弃该数据的依据,如果头动超过1个voxel(功能图像扫描矩阵一般是64*64,则体素的大小为(FOV/64)*(FOV/64)*(层厚+层间距)),则要考虑放弃该时间点数据。该程序利用最小二乘法(leastsquar

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