spm deformation

已于 2023-10-13 04:00:32 修改
阅读量291 收藏
点赞数
分类专栏： 磁共振数据处理 文章标签： 图像处理
于 2021-08-13 18:13:19 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Olinwander/article/details/119681503
版权

spm 分割与空间变换

spm segment生成的_sn.mat文件，可以输入到deformation里面，使用pushforward功能将标准空间的mask配准到个体空间区。说明_sn文件携带了MNI空间到个体空间的变换信息。
对应的inv_sn.mat方向是相反的，从个体空间到标准空间。所分割完成，想要获取一些新的图像，可以用deformation来完成。

Olinwander
关注
专栏目录
磁共振实验数据SPM8处理流程（继续）
03-24 1万+
继续上一次的话题，做完了Slice Timing，接下来就该进行头动校正了。 2、Realignment 头动校正         即使我们对被试的头部做了很好的固定，在实验过程中，被试也会不由自主的有一些轻微的头动，这在fMRI实验中尤为明显。这一步就是把一个实验序列中的每一帧图像都和这个序列的第一帧图像按照一定的算法做对齐，以矫正头动。         目的：如果在容许的头动范围内，可以
fMRI学习笔记：预处理及数据分析（使用spm12）
weixin_66449744的博客
07-15 1万+
用SPM对fMRI数据文件进行预处理、个体分析及组分析的学习笔记
spm mri segmentation：GM,WM,CSF 及DARTEL normalize
清舞 点滴
06-08 8007
简要总结了spm12(+dartel)对MRI脑部图像进行segment和normalize
SPM12入门案例1
The_best_man的博客
05-15 1万+
如何使用SPM入门 1.准备工作 (1)数据下载 使用样例Auditory fMRI dataset，数据来源于官网下载未处理的数据Raw functional and structural data。 (2)创建文件夹 创建名为auditory的文件夹，在该文件夹下创建三个子文件夹分别是dummy,jobs,classical分别用于存放dummy scans、job-specificati...
spm 使用说明
04-25
该文件为使用spm的详细说明，也可以在spm官网上下载
SPM12 核磁数据预处理 傻瓜攻略
热门推荐
Iris_bysshqx17的博客
09-01 5万+
人生最痛苦的事不是没得选择，而是选择太多而不知道究竟哪个是对的。这份傻瓜攻略写给我自己，因为我真的服了自己的脑子了。咋么能这么傻呢？ 希望有人看到这篇文章之后可以不需要再看其它的文章就可以顺利地从头分析到尾。也希望我不要下一次分析的时候又忘了这些经验。 当然，要是想知道原理之类的还是要出门左拐。 SPM（Statistical Parametric Mapping）已经拥有挺久的历史了，这个软件出...
SPM数据预处理【“傻瓜”操作版】
2301_79000620的博客
07-13 2065
本文为spm12对fmri数据进行预处理的操作步骤，简单易懂，看图操作即可。
基于SPM12对fMRI数据进行预处理及其批处理
qq_43575939的博客
01-29 1万+
还在修建中，改日加，，，先当做目录康康叭，，，感谢 spm软件介绍 spm12界面和基本内容 spm的使用步骤 spm的具体参数和使用中的注意事项 单个数据处理 批处理 参考文献和博客
学习笔记｜fmri_4 预处理 co- register segment normalize smooth SPM12
weixin_44669441的博客
11-17 3493
到这里可以往回看预处理包括哪些步骤：可视化（Visualization）、去伪影（Artifact removal）、时间配准（Slice time correction）、头动校正（Motion correction/realign）、生理噪音校正（Correction for physiological effect）、结构功能配准（Co-registration）、标准化（Normalization）和时空间滤波（Spatial and temporal filtering）。 注：很多教程的预处理步
为了获得原生rs-fMRI数据空间皮层区域的mask，如何用spm12将T1配准到rs-fMRI并共同配准到MNI-152空间，之后再返回到原始rs-fMRI空间
06-08
下面是使用SPM12将T1配准到rs-fMRI并共同配准到MNI-152标准空间，然后再返回到原始rs-fMRI空间的步骤： 1. 打开SPM12软件，点击菜单栏中的"Batch"，选择"New batch"，打开Batch Editor界面。 2. 在Batch Editor...
VBM8处理流程.pdf
07-04
- "Deformation fields": 非线性变换产生的变形场。 - **保存与运行批处理:** 通过"File → Save Batch"保存设置好的批处理，可以保存为*.m或*.mat文件；通过"File → Run Batch"执行批处理。 **预处理结果显示与...
学习记录——SAM、SPM
Chaoy6565的博客
07-18 1089
能分割一切的模型 2023  SAM是一个提示型模型，其在1100万张图像上训练了超过10亿个掩码，实现了强大的零样本泛化。许多研究人员认为「这是 CV 的 GPT-3 时刻，因为 SAM 已经学会了物体是什么的一般概念，甚至是未知的物体、不熟悉的场景（如水下、细胞显微镜）和模糊的情况」，并展示了作为 CV 基本模型的巨大潜力。   2023年4月6号，Meta AI公开了Segment Anything Model（SAM），使用了有史以来最大的分割数据集Segment Anything 1-Bill
fmri 分析数据 fsl & spm 两大平台比对
weixin_34343308的博客
07-06 778
基于下面这份ppt：Comparing SPM and FSL， bylChris Rorden 1 fsl & spm都是免费的，都很受欢迎。spm更受欢迎。 　　 1 两者的区别在于何时利用normalise 归一化操作。 1 2 二者的头动矫正算法是不同的： spm是基于...
SPM12入门案例2
The_best_man的博客
05-28 8931
Face fMRI data 要求实验者通过按键来判断知名度。因此这里有4种兴趣的类型；第一二步显示出有知名度和没有知名度的人脸，代表着N1,N2,F1和F2。 ###准备工作 通过EPI获得图像，其中回复时间TE=40ms，重复时间TR=2s，24个下降的切片，3mm厚和1.5mm间距。 数据获取：Face Repetition dataset 创建face_rep的文件夹用来存放分析的...
使用SPM12对fMRI数据进行预处理和统计分析
Doris.Liu的博客
03-17 4188
使用基于Matlab的SPM12来处理fMRI数据，对数据进行预处理和统计分析。
spm用于颅骨去除和配准
最新发布
Dream19961996的博客
03-08 1095
出现这个界面就一直等待即可：
spm + host
ayu124821的博客
07-17 244
spm参数 ： 为了页面的pv统计。我们可以使用服务端直接统计其请求数目；也可以直接在客户端埋点的方式，访问某个页面的时候，直接向服务端发送一条埋点日志，日志服务器处理后给pv。后者的这种方式就是spm。 spm做的就是更加精细的埋点，为每个链接都进行编码，if： spm=spmA.spmB.spmC.spmD.spmE spmA 唯一...
图论分析方法gretna_预计的数据分析流程以及一些问题
weixin_36378771的博客
01-17 7266
1.数据预处理(到smooth)SPM12 (去掉前10层，时间层校正，头动校正，功能像结构像对齐，结构像分割，Normalise到标准空间，Smooth)2.数据预处理之detrend和filter，回归掉CSF和WM的协变量，然后用Scrubbing(？)去头动伪迹GRETNA(大概需要整理一下文件夹的结构，所以这个软件需要的文件夹结构是怎样？)或者DPARSF或者REST，GRETNA使用s...
matlab spm批量配准
gyc的博客
08-05 1498
spm批量配置脚本
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值