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医学影像处理
文章平均质量分 63
chs_502
无基础、无经验、无能力的计算机初学者
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基于三维医学影像数据的CAM可视化——PyTorch实现
基于三维医学影像数据的CAM可视化——PyTorch实现原创 2023-01-11 22:14:59 · 1971 阅读 · 11 评论 -
MRI图像切片(nii格式转2D)
代码参考:将一个MRI(nii格式)数据进行切片想要批量抽取MRI数据的几个切片,借鉴了上述代码的Python版本,原始代码抽取了全部切片。本次实验主要是抽取sMRI的横断面(axial)方向的其中30张切片,数量根据自己需求可自行设置。import scipy, numpy, shutil, os, nibabelimport sys, getoptimport imageiodef niito2D(filepath): inputfiles = os.listdir(filep原创 2021-03-08 20:15:54 · 6229 阅读 · 11 评论 -
MRI图像预处理流程
最近在学习医学影像处理,主要是基于sMRI,记录一下一些预处理过程,希望对一些人有帮助。首先是ACPC校准:前连合(anterior commissure, AC)后缘中点 至 后连合(posterior commissure, PC)前缘中点 的连线,又称AC-PC线。脑立体定向手术和X-刀、Y-刀治疗多以此线为准,故脑立体定位断层解剖研究多以此线为基线。选用的MATLAB下的SPM12工具,在网上找的批处理代码:参考文章——ACPC看一下效果,原图为:原始数据ACPC校准:原创 2020-12-09 22:03:29 · 7258 阅读 · 6 评论