MNE之源估计数据结构

上回完成了源成像,在三维交互窗口中也可以动态显示目标位置的信号曲线。那么逆运算得到的数据是什么呢?这一节讨论一下源估计的返回值SourceEstimate对象,以便后续分析使用。 

源估计

        源估计,英文:Source estimates,也常称为STC (Source Time Courses),源时间序列/进程(不清楚哪个翻译更准确些),这也可以理解官方用stc作为逆运算返回变量名。通过相关的源定位方法求解,如:dSPM, sLORETA, LCMV, MxNE 等,将传感器数据转换到3维源空间(尤其定位到个体大脑解剖结构中,包括surface和volume两种)。

        源估计结果stc对象包含了源随时间变化的幅值。而源的位置信息则在正运算的src中。如下图所示,三维皮层上每个点(vertex)对应一个时间序列,我们将所有点的数据写入到一个矩阵中,行表示每个空间点,列标识每个时间点,每个值即为某个位置对应时间点的信号强度。MNE逆运算中stc.data即为这个矩阵。

源空间

        上节提到stc对象中不包含位置信息,但包含了位置索引(stc.vertices),通过索引链接到src。FreeSurfer 将大脑两个半球分开,并为左半球和右半球创建曲面表示。索引即构建曲面的(三角形网格)点。stc的属性:lh_data 和 rh_data 分别获取左右脑的源估计;lh_vertno,rh_vertnof分别获取左右脑的顶点索引(一共7498个点,其中左半脑3732个)。对应 src[0]['vertno'] and src[1]['vertno'];而坐标值在 src[0]['rr'] and src[1]['rr']中。

        stc.plot返回值时mne.viz.Brain类的对象。可通过add_foci方法添加焦点。

总结

学习源估计数据结构。

以上,如有问题,还请不吝赐教

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