Linux CentOS8/RedHat8安装flow3d-11.2及使用

说明：FLOW-3D是一款专门用于解决瞬态自由表面问题的高精度CFD软件，详情可访问FLOW-3D官网；文章仅介绍flow3d在HPC集群上个人用户没有root权限情况下的安装方法，安装包需自行下载。

安装参考：flow3d解压后的V11.2/Crack/readme_linux.txt。

一、解压

tar xzf flow3d-linux-V11.2.tar.gz
cd V11.2/
7z x FLOW-3D.11.2.LINUX64.iso -oFLOW-3D.11.2.LINUX64

说明：文件解压很耗时，可在win解压，再上传到系统上，解压后目录中的iso文件也可在win挂载，上传到Linux上。

二、安装

下面提供两种安装方式，可根据自身情况选择：

1. 命令行操作

由于没有root权限，需要对安装脚本作如下修改：

# 注释root权限判断
sed -i '57,60s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
# 没有root权限，注释使用rpm，使用rmp2cpio
sed -i '590,612s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
sed -i '634s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
sed -i '647,661s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
sed -i '675s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
sed -i '687,701s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
sed -i '714s/^/#/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
# 脚本中会返回“.” ，改为指定脚本所在目录的绝对路径
sed -i '5s/SCRIPTDIR="`dirname "$0"`"/SCRIPTDIR=$(dirname $(readlink -f $0))/' FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
sh FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh
# 依次输入以下内容
> no
> yes
> /path/to/flow3d-install/
> 1
> yes
> 27025@127.0.0.1
> no
> no

2. 图示版操作

如果手动修改安装脚本，请vim打开FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh，将以下红框中的内容注释：
1）注释root权限判断；

2）没有root权限，注释使用rpm，将使用rmp2cpio解压rmp文件；

3）脚本中默认会返回“.” ，改为SCRIPTDIR=$(dirname $(readlink -f $0))，指定脚本所在目录的绝对路径；

4）执行sh FLOW-3D.11.2.LINUX64/install-flow3d.sh，按照下列图示操作：

到这里flow3d-11.2基本就安装好了，下一步只需要打上补丁即可。

三、 Crack

解压FLOW.SCIENCE.FLOW-3D.11.2.LINUX64-SSQ.tar.xz到flow3d安装目录进行覆盖：

export FLOW3D_HOME=/path/to/flow3d-install
tar Jxf Crack/FLOW.SCIENCE.FLOW-3D.11.2.LINUX64-SSQ.tar.xz -C $FLOW3D_HOME

四、测试

拷贝$F3D_HOME/examples/boxcast/prepin.inp到测试目录，使用以下脚本提交：

#!/bin/bash
#SBATCH -p partion
#SBATCH -N 1

# flow3d环境
export F3D_HOME=$FLOW3D_ROOT
export F3D_VERSION=double
ulimit -s unlimited
export FLEXLM_TIMEOUT=30000
export F3D_HELP=/usr/bin/firefox
export PATH=$F3D_HOME/local:$PATH
export PATH=$F3D_HOME/gui:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$F3D_HOME/gui/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$F3D_HOME/gui/lib/qt:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$F3D_HOME/gui/lib/ifort:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=$F3D_HOME/licenses:$PATH
export LICENSE=$F3D_HOME/licenses/flow3d.lic

# 检查license是否启动，如果没有则启动license
if ! lmstat -c $LICENSE | grep "license server UP"; then
	lmgrd -c $LICENSE &
	#再次检查license是否启动，未启动则退出
	if lmstat -c $LICENSE | grep "lmgrd is not running"; then
        echo "Failed to start license server. Exiting."
        exit 1
	fi
fi
# 如果之前测试过，需要把生成的文件删除才能重新测试
rm *.tmp *.dat
srun --unbuffered runhyd
# 关闭license
lmdown -c $LICENSE -q

说明：--unbuffered确保srun的输出不会被缓冲。

如果你在输出日志末尾看到FLOW-3D complete，则说明运行成功。