在Centos6.5编译R3.1.0

趁着新机器的热呼劲，重新编译了R3.1.0:

CentOS 6.5 x64

R 3.1.0

openblas 0.28

Rstudio 0.98

Rstudio Server 0.98 

Windows下用openblas替换rblas，Rstudio就起不来了，似乎R重新编译就能解决问题，但MinGW openblas和R报了很多错误，在Linux上体现高性能的R以及Rstudio可视化开发是可行的。

1 EPEL源（EPEL上有openblas）

wget http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/i386/epel-release-6-8.noarch.rpm

rpm -ivh epel-release-6-8.noarch.rpm

2 安装openblas

rpm -ivh openblas*

3 编译R 3.1.0

使用openblas和lapack，允许Rstudio连接，在centos6.5上编译R的命令./configure --enable-R-shlib --with-blas="-lopenblas" --with-lapack=yes

4 Testing

张权在4C8T CentOS上跑的成绩

> x <- matrix(1:(6000 * 6000), 6000, 6000)
> system.time(tmp <- x %*% x)
  用户   系统   流逝
15.563  0.044 15.611

刘思喆在2C4T ubuntu上跑的成绩

x <- matrix(1:(6000 * 6000), 6000, 6000)
system.time(tmp <- x %*% x)
   user  system elapsed 
 37.964   0.320  19.434