Python 量子计算教程之Psi4 中的谐波分析

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本文是Python量子计算教程的一部分,讲解如何利用Psi4库进行分子的谐波分析。首先优化分子几何,然后在hartree-fock级别进行波函数优化并进行频率计算。谐波分析的输出可能包含虚数频率,暗示几何结构未完全优化,这需要进一步研究。
摘要由CSDN通过智能技术生成

分子振动,这是我们都知道的。这些振动特征可能对未来的研究有用。工业上常用红外光谱法测量振动。所以让我们从上次我们只估计 Z-Matrix 形式的坐标的甲醇中获取:

H11
O11  H11  0.9600
C11  O11  1.4000  H11  108.0000
H12  C11  1.1000  O11  112.0000  H11  -60.0000
H13  C11  1.1000  O11  112.0000  H11   60.0000
H14  C11  1.1000  O11  111.8699  H11 -180.0000

所以我们的计划是优化分子的几何形状,一旦我们达到最小状态,我们就想返回那个波函数并对分子进行谐波分析以获得振动模式。Whew 听起来很多,所以让我们分解一下,首先让我们按照您可以在我之前的博客中找到的方式进行一些初始配置。

import psi4

psi4.set_memory('1000mb')
psi4.core.set_num_threads(1)

psi4.set_options({
     'scf_type': 'df',
     'g_convergence': 'gau_tight',
     'freeze_core': 'true',
})

zmatrix = '''\
H11
O11  H11  0.9600
C11  O11  1.4000  H11  108.0000
H12  C11  1.1000  O11  112.0000  H11    0.0000
H13  C11  1.1000  O11  112.0000  H11  120.0000
H14  C11  1.1000  O11  111.8699  H11 -120.0000
0 1
'''

universe = psi4.geometry(zmatrix)
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