R 语言命令收集

在这里存粹就是一个笔记本,将自己碰到过一些 R 语言命令记录下来,免去重复查找!!

记得增加如下命令:

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
  • reshape2::melt(data, …, na.rm = FALSE, value.name = “value”)
    将 data 数据按照某(列)原则更改形状
    详细内容请点击这里
  • data.table 快速上手 详细内容请点击这里
  • data.table 使用函数 .N 来得到每个类别的总观测数, 详细内容请点击这里
  • data.table 使用 := 引用来添加或更新(甚至删除)一列
  • nrow, ncol 返回数组,table 的行数与列数
  • a %in% table
    a 值是否包含于 table 中,为真输出 TURE, 否则输出 FALSE
  • paste (…, sep = ” “, collapse = NULL)
    paste 函数将他的参数转换为字符串并连接他们,字符串之间用 seq 间隔分开。
  • paste0(…, collapse = NULL)
  • vector(mode = “logical”, length = 0)
    model 一个原子模式命名的字符串或 “list” 或 “expression” 或(除了向量外的) “any”
    length 一个非负整数,指定所需的长度。对一个长的向量,即 length>.Machine$integer.max 时,length 必须是“双精度”型。提供一个不是 1 的参数给 length 是错误的。
  • ceiling(x)
    返回不小于该数字的最小整数
  • sample()
    返回随机样本和排列 详细内容请点击这里
    -matrix()
    创建矩阵,详细内容请点击这里
    -colSums(), rowSums()
    分别对矩阵每一列进行求和,分别对矩阵每一行进行求和,详细内容请点击这里
    -lapply(X,FUN,…)
    lapply 的返回值是和一个和X有相同的长度的 list 对象,这个 list 对象中的每个元素是将函数 FUN 应用到 X 的每一个元素。其中 X 为 List 对象(该 list 的每个元素都是一个向量),其他类型的对象会被 R 通过函数 as.list() 自动转换为 list 类型。
    更多内容请点击这里
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R语言可以用于进行Meta分析。Meta分析是一种根据明确的搜索策略、选择筛选文献标准、采用严格的评价方法,对来源不同的研究成果进行收集、合并及定量统计分析的方法。在R语言中,有许多用于进行Meta分析的包,比如meta、metafor、dmetar等。这些包提供了完整有效的数据处理、统计分析与保存机制,可以直接对数据进行分析和显示。R语言命令格式简单,结果可读性强,非常适合进行Meta分析的操作。通过使用这些包,你可以进行Meta整合分析、异质性检验、不确定性分析等。 以meta包为例,你可以使用install.packages("meta")命令来安装meta包,然后使用library(meta)命令来加载这个包。接下来,你可以使用metagen函数来进行Meta分析,指定需要分析的效应量和标准误差,以及其他参数设置。最后,你可以使用summary函数来查看Meta分析的结果。 需要注意的是,在进行Meta分析时,需要进行严格的方法选择和结果解释,以确保结果的可靠性和有效性。同时,还可以结合机器学习等方法,进行Meta分析在文献大数据的延伸应用。 总结起来,R语言提供了丰富的工具包和函数,可以进行Meta分析及其相关的操作和分析。使用R语言进行Meta分析可以帮助研究人员从不同研究中汇总和综合数据,得出更加准确和全面的结论。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* *2* [基于R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习](https://blog.csdn.net/weixin_46433038/article/details/125058741)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *3* [用R进行meta分析(meta包)](https://blog.csdn.net/weixin_58566962/article/details/125605411)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]

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