PBS作业提交系统集群搭建（以Torque4.2.3为例）

PBS简介  

      PBS是一个批处理作业和计算机系统资源管理软件包，它就可以接受批处理作业、shell脚本和控制属性，作业运行前对其储存并保护，然后运行作业，并且把输出转发回提交者。PBS可以被安装并配置运行在单机系统或多个系统组来支持作业处理。由于PBS的灵活性，多个系统可以以多种方式组合。

PBS安装环境及所需安装包

    本文以Red Hat Enterprise Linux 6.3为例，在VM上运行iso镜像，安装Torque4.2.3，首先需要安装gcc编译器，否则在安装torque时会提示你不能make，需要安装一些安装包。系统提示的安装包可以在iso镜像中找到，在虚拟机设置中可以选择显示，打开光盘 Red Hat Enterprise Linux 6中会发现packages文件夹，在文件夹中可以找到你所需的安装包，在安装过程中可能会提示你安装其他安装包，比如安装openssl-devel时会提示你安装krb5-devel以及其他安装包，找到你的系统所需要的安装包（32位为i586，64位为x86_64）递归进行安装，并安装gcc编译器（也可在光盘中找到）。

PBS安装前配置

1. 配置基于非root账号的管理头节点到各个通用计算服务节点的ssh无密码互联，方法见我的另一篇博客：点击这儿
   • TORQUE提交作业的命令qsub不能以root帐号运行，故此非root帐号将用作提交任务
   • 同时TORQUE作业队列是和非root帐号做一对一绑定的，创建队列时也需要该非root帐号
2. 配置集群中的 hosts 解析关系(具体的配置方法见这个专题中的第一篇博客：点击这儿)，这儿不配的话不再是速度快慢的问题了，而是pbs管理头节点根本无法发现集群中的通用计算服务节点，总会报如下错误：

   • pbsnodes: Server has no node list MSG=node list is empty - check 'server_priv/nodes' file

3. 在管理头节点上安装torque-4.2.3.1

   • ./configure --prefix=/usr/local/torque-4.2.3.1
     make
     make install

   • 产生需要安装到通用计算服务节点上的包（这一步具体产生哪些包，分别是什么作用等我完全搞明白了再来补充），具体的安装过程放在后面配置通用计算服务节点的时候讲解

     • make packages

4. 添加 torque 的可执行文件目录到环境变量 $PATH（管理头节点、所有通用计算服务节点都添加