2021-03-19

关于服务器 Xshell 和 文件传输XFTP

1、首先我说一下关于这两个软件的下载安装，下载的话直接搜索进入官网NetSarang去下载，如果在网上下载压缩包那些都是有试用期的，因为对于Xshell & XFTP，它获取破解版的需要你更改一下使用目的，然后需要你注册填写一下邮箱。网址如下：https://www.netsarang.com/zh/xshell-download/；你可以选择Xshell、XFTP同时下载或者只下载其中一个。根据他给你发的邮箱指引进行下载安装。点击链接进去就会自动下载，如果没有自动下载，再手动点击。

2、下载安装一般就是默认的路径就好了，如果要更改也行。之后进入Xshell，这里一开始是新建一个会话，重要的是主机、端口号、之后点击确定；再进去点击连接，会需要你输入用户名 & 密码，可以记住密码，这样下次再连接就不用输入密码这些了。

 

3、对于XFTP文件传输，我在这里卡了很多次，这里主要说一下，我一直没注意的问题，就是注意构建连接的协议，我之前一直以为就是XFTP，连不上，还以为是端口号、主机这些的问题，后来无意中把SFTP改成FTP之后就连上了。

4、这样就实现本地文件与服务器文件的互传，并且一些大程序需要挂到服务器上去运行，本地电脑会直接卡崩。下面我就说一个简单的例子，在服务器运行R程序。（因为我主要学R，生物信息数据分析用的多） 

（1）编写R脚本文件，即R代码，保存成 name.R。

（2）编写与.pbs文件，这是在服务器运行程序语言的一种方式，目前我只会这种。具体pbs文件的编写格式以及每一行代表什么，可以去百度一下。挺简单的。主要的就是后面两行。

（3）如果R脚本文件 & pbs（pbs保存为 name.pbs ）文件都写好了，并且都在服务器上，在保证代码没问题的基础上，只要在Xshell运行 qsub  name.pbs就可以了。 

（4）另外讲几个有用的命令： 

1.  qstat : 查看本用户当前提交的任务。

2. pbsnodes –a  ：查看当前服务器各节点任务状态。

3. qsub script.pbs ：提交作业。

4. qstat –f tasked ：查看已提交的作业。

5. qdel [-W 间隔时间] tasked （-W 表示间隔多少时间之后删除） ：删除已提交的作业。

6. qstat : 查看本用户提交的任务。其中可以在qstat -n/-q。

7. showq : 查看系统中所有运行的任务。