Spark每日半小时(26)——数据源:JDBC到其他数据库、故障排除

Spark SQL还包括一个可以使用JDBC从其他数据库读取数据的数据源。与使用JdbcRDD相比,此功能应该更受欢迎。这是因为结果作为DataFrame返回,可以在Spark SQL中轻松处理,也可以与其他数据源连接。JDBC数据源也更易于使用Java或Python,因为它不需要用户提供ClassTag。(注意,这与Spark SQL JDBC服务器不同,后者允许其他应用程序使用Spark SQL运行查询)。

首先,需要再Spark类路径中包含特定数据库的JDBC驱动程序。例如,要从Spark Shell连接到postgres,将运行以下命令:

bin/spark-shell --driver-class-path postgresql-9.4.1207.jar --jars postgresql-9.4.1207.jar

可以使用Data Sources API将远程数据库中的表加载为DataFrame或Spark SQL临时视图。用户可以再数据源选项中指定JDBC连接属性。user和password通常作为用于登录数据源的连接属性提供。除连接属性外,Spark还支持以下不区分大小写的选项:

属性名称含义
url要连接的JDBC URL。可以在URL中指定特定于源的连接属性。例如,jdbc:postgresql://localhost/test?user=fred&password=secret
dbtable应该读取的JDBC表。请注意,FROM可以使用在SQL查询的子句中有效的任何内容。例如,您也可以在括号中使用子查询,而不是完整的表。
driver用于连接到此URL的JDBC驱动程序的类名。
partitionColumn, lowerBound, upperBound如果指定了任何选项,则必须全部指定这些选项。另外, numPartitions必须指定。它们描述了在从多个工作者并行读取时如何对表进行分区。 partitionColumn必须是相关表格中的数字列。请注意,lowerBoundupperBound只是用来决定分区步幅,而不是在表中过滤行。因此,表中的所有行都将被分区并返回。此选项仅适用于阅读。
numPartitions表读取和写入中可用于并行的最大分区数。这还确定了最大并发JDBC连接数。如果要写入的分区数超过此限制,我们通过coalesce(numPartitions)在写入之前调用将其减少到此限制。
fetchsizeJDBC提取大小,用于确定每次往返要获取的行数。这可以帮助JDBC驱动程序的性能,默认为低读取大小(例如,Oracle有10行)。此选项仅适用于阅读。
batchsizeJDBC批处理大小,用于确定每次往返要插入的行数。这可以帮助JDBC驱动程序的性能。此选项仅适用于书写。它默认为1000
isolationLevel事务隔离级别,适用于当前连接。它可以是一个NONEREAD_COMMITTEDREAD_UNCOMMITTEDREPEATABLE_READ,或SERIALIZABLE,对应于由JDBC的连接对象定义,缺省值为标准事务隔离级别READ_UNCOMMITTED。此选项仅适用于书写。请参阅文档java.sql.Connection
sessionInitStatement在向远程数据库打开每个数据库会话之后,在开始读取数据之前,此选项将执行自定义SQL语句(或PL / SQL块)。使用它来实现会话初始化代码。例:option("sessionInitStatement", """BEGIN execute immediate 'alter session set "_serial_direct_read"=true'; END;""")
truncate这是JDBC编写器相关选项。当SaveMode.Overwrite启用时,此选项会导致火花截断,而不是删除和重建其现有的表。这可以更有效,并防止删除表元数据(例如,索引)。但是,在某些情况下,例如新数据具有不同的架构时,它将无法工作。它默认为false。此选项仅适用于书写。
createTableOptions这是JDBC编写器相关选项。如果指定,则此选项允许在创建表时设置特定于数据库的表和分区选项(例如,CREATE TABLE t (name string) ENGINE=InnoDB.)。此选项仅适用于书写。
createTableColumnTypes创建表时要使用的数据库列数据类型而不是默认值。数据类型信息应以与CREATE TABLE列语法相同的格式指定(例如:"name CHAR(64), comments VARCHAR(1024)")。指定的类型应该是有效的spark sql数据类型。此选项仅适用于写入。
customSchema用于从JDBC连接器读取数据的自定义架构。例如,"id DECIMAL(38, 0), name STRING"。您还可以指定部分字段,其他字段使用默认类型映射。例如,"id DECIMAL(38, 0)"。列名应与JDBC表的相应列名相同。用户可以指定Spark SQL的相应数据类型,而不是使用默认值。此选项仅适用于阅读。
    private static void runJdbcDatasetExample(SparkSession spark) {
        // $example on:jdbc_dataset$
        // Note: JDBC loading and saving can be achieved via either the load/save or jdbc methods
        // Loading data from a JDBC source
        Dataset<Row> jdbcDF = spark.read()
                .format("jdbc")
                .option("url", "jdbc:postgresql:dbserver")
                .option("dbtable", "schema.tablename")
                .option("user", "username")
                .option("password", "password")
                .load();

        Properties connectionProperties = new Properties();
        connectionProperties.put("user", "username");
        connectionProperties.put("password", "password");
        Dataset<Row> jdbcDF2 = spark.read()
                .jdbc("jdbc:postgresql:dbserver", "schema.tablename", connectionProperties);

        // Saving data to a JDBC source
        jdbcDF.write()
                .format("jdbc")
                .option("url", "jdbc:postgresql:dbserver")
                .option("dbtable", "schema.tablename")
                .option("user", "username")
                .option("password", "password")
                .save();

        jdbcDF2.write()
                .jdbc("jdbc:postgresql:dbserver", "schema.tablename", connectionProperties);

        // Specifying create table column data types on write
        jdbcDF.write()
                .option("createTableColumnTypes", "name CHAR(64), comments VARCHAR(1024)")
                .jdbc("jdbc:postgresql:dbserver", "schema.tablename", connectionProperties);
        // $example off:jdbc_dataset$
    }

故障排除

  • JDBC驱动程序类必须对客户端会话和所有执行程序上的原始类加载器可见。这是因为Java的DriverManager类进行了安全检查,导致它忽略了当打开连接时原始类加载器不可见的所有驱动程序。一种方便的方法是修改所有工作节点上的compute_classpath.sh以包含驱动程序JAR。
  • 某些数据库(如H2)会将所有名称转换为大写。我们需要使用大写字母在Spark SQL中引用这些名称。
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