- 博客(2)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 【水环境病原菌数据库开发心得】
DPiWE数据库收录了人类疾病、鱼类疾病及跨宿主共患病等六类疾病中的13个门（包括4个变形菌纲），116个科，221个属和1097个种下的9070株细菌病原信息（主要为细菌分类学、侵染途径和宿主信息等）和对应的16S rRNA基因序列数据。这些信息均在web端公开（dayuz.com或http://pathogen.umehd.com/），并且通过内置NoSQL数据库、Rserve和Usearch全局搜索软件实现了对病原菌信息检索、序列比对和注释结果可视化等功能。
2022-11-08 23:45:00
562
2
原创 利用BLAST进行序列比对和寻找同源基因
NCBI BLAST是最常用的短序列局部比对软件之一，学习一下软件参数，并这记录一下我的软件操作的命令行。NR 库分割参考Gu Kai老师的笔记：http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/6731. 软件版本 我部署在服务器上的是version 2.8.1 ，因为其支持物种注释以及分割的NR子库的索引作为比对的库，使用比较方便，但...
2019-03-10 21:46:04
35440
7
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人