安装部署（十一） Ubuntu下Rmpi安装测试

最新推荐文章于 2024-03-28 16:04:06 发布

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分类专栏：安装部署文章标签： ubuntu R Rmpi

本文链接：https://blog.csdn.net/dst1213/article/details/52468055

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本文详细介绍了在Ubuntu 14.04上安装和测试Rmpi的步骤，包括通过R CMD INSTALL和R包管理器安装Rmpi，设置环境变量，以及运行测试代码mpi_test.r进行多机测试。提供了相关资源链接和日志管理方法。

摘要由CSDN通过智能技术生成

Ubuntu下Rmpi安装测试

ubuntu 14.04
openmpi 0.10[可参考本人之前的mpi4py安装教程]
R 3.03

在所有机上执行：
1、安装：
参考：
http://www.stats.uwo.ca/faculty/yu/Rmpi/
方法一：Rmpi安装包
root@py-14:/projects# R CMD INSTALL Rmpi_0.6-6.tar.gz
方法二：R下安装Rmpi
>install.packages("Rmpi")
2、环境变量【可选，如果使用出问题的话，可以设置一下】
参考：
https://wiki.gacrc.uga.edu/wiki/Rmpi

LD_LIBRARY_PATH
MPI_ROOT

3、使用
参考：
https://bioinfomagician.wordpress.com/2013/12/02/rmpi-tutorial-2-sending-data/
https://rc.fas.harvard.edu/resources/documentation/software/r-mpi/
http://blog.nguyenvq.com/blog/2010/01/20/scheduled-parallel-computing-with-r-r-rmpi-openmpi-sun-grid-engine-sge/【结合snow】
3.1 测试代码 mpi_test.r
# Load the R MPI package if it is not already loa