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胖胖雕
这个作者很懒，什么都没留下…
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Coding and Paper Letter（八十九）
CPL之第八十九期。原创 2024-04-10 14:55:30 · 912 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十八）
系列重启之CPL。原创 2024-04-07 18:43:11 · 1028 阅读 · 0 评论 -
R语言读取大型NetCDF文件
先给一段Wiki上关于NetCDF的定义。本质上NetCDF是一个多维矩阵的数据，常用于地球科学领域的数据存储。wiki百科定义给出一个典型的例子（CHAP的O3数据）。原创 2024-03-10 22:29:35 · 1272 阅读 · 0 评论 -
应用统计学与R语言实现笔记（番外篇四）——bookdown使用与OR值计算
本期是之前做的应用统计学与R语言实现笔记的番外篇四，本期主要关注两个问题，一个是重新利用R的bookdown包创建新的电子书，另一个是计算公共卫生当中一个比较常见的指标OR值。文章目录1 bookdown使用2 公式更正3 OR值计算1 bookdown使用bookdown是谢益辉之前开发的R语言包，可以基于rmarkdown快速生成在线电子书，并且可以输出pdf和epub。具体的使用方法可以参见官方文档。https://bookdown.org/yihui/bookdown/这里由于中文在输原创 2021-03-17 19:43:16 · 2161 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十七）
大家新年好，新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper：1 Coding:1.针对R语言新手的shiny培训教程。shiny beginners2.R语言包tinter，用于获取颜色的色调和阴影。tinter3.Power BI的培训研讨会。pbiworkshops4.使用C语言的API测试GEOS的性能。geos performance5.R语言包exploreRGEE，探索RGEE-Google Earth Engine的包。exploreRGEE6.Sh原创 2021-03-09 05:38:34 · 1388 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十六）
大家新年好，新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包radiant.basics，使用R和shiny的商业分析软件包。radiant.basics2.一个用于探索和发布数据的开源多功能工具，Datasette是用于浏览和发布数据的工具。 它可以帮助人们获取任何形状或大小的数据，并将其发布为交互式，可探索的网站和API。datasette3.关于作者硕士论文的技术部分，基于Google Earth Engine实现的结合Landsat和Sen原创 2021-01-08 05:15:38 · 2696 阅读 · 2 评论 -
Coding and Paper Letter（八十五）
新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.阿根廷地质协会（AGA）于2020年8月和9月提供的“地理信息学应用于多专题制图”课程的虚拟课程。AGA Geoinformatica 20202.R语言包glmmTMB，基于Template Model Builder拟合广义线性混合效应模型。glmmTMB3.Python库rich，是一个Python库，用于在终端中显示富文本和精美格式。rich4.Python库Mici，提供了概率模型中近似推论的马原创 2020-12-18 19:07:11 · 4720 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十四）
最近忙于研究事宜，许久未归。新一期资源整理博客。1 Coding:1.Python的Geohash编码压缩工具。georaptor2.基于Google Earth Engine平台用于洪涝灾害的水文遥感分析包。hydra floods3.Python库moto，一个使您能够轻松模拟基于AWS基础架构的测试的库。moto4.R语言包helpr，可以改善友好的HTML文档。helpr5.Binder实例与地理信息科学和技术知识体系的章节进行交互。bok chapter notebook原创 2020-11-25 18:23:28 · 1486 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十三）
新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.快速生成三维球几何图形。fast icosphere2.mapskin是地理空间可缩放矢量图标的集合。mapskin3.Python库TSFRESH，自动从时间序列中提取相关特征。tsfresh4.R语言包tsfeatures，从时间序列数据中提取各种特征。tsfeatures5.xarray的教程。提供样例的jupyter notebook。xarray tutorial6.用React组件渲原创 2020-06-18 18:24:33 · 2309 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十二）
新一期资源整理博客。1 Guide：Coding and Paper Letter这个系列的博客第一篇起源于2018年7月7日，做这个系列的初衷可以用下面这张图来代表，我手机上关注的公众号在一天时间内可以推送给我193条推送，信息量之大可见一斑。当前是一个快速阅读或者叫快餐式阅读的时代，大量的信息堆砌。因此我发觉资源整理是非常关键的。于是在7月7日我正式开始在博客上更新这个系列，在此期间也收到了不少读者的评论。当然我自己也受益良多。这个系列其实就是针对我看到的一些coding资源以及泛读论文（读题目原创 2020-05-29 22:30:58 · 1253 阅读 · 0 评论 -
关于GIS的一些感悟·思考
本文想法和初步动笔起源于10号，但是最近事情比较多，一直到现在才完稿。其实起源是从5月初本科学弟学妹的毕业答辩开始的，主要谈一谈听完答辩的感悟以及对于GIS学科的一些引申思考。文章目录1 Defence:2 Topics1 Defence:由于疫情的原因，今年本科学院的学弟学妹毕业论文答辩采用了腾讯会议网上形式。不过由于各种原因，听得比较完整的还是直系基地GIS方向的答辩，因此也就针对这几个内容稍微提点东西。先Po一下大家的题目。一共是9位参与答辩。第一位是基于新浪微博对洪水灾害时间主题挖掘与淹原创 2020-05-21 07:58:44 · 2497 阅读 · 3 评论 -
Tutorial of the Website "Awesome of COVID-19"
My Ph.D. project will focus on the application of spatial technology in Spatial Lifecourse Epidemiology. With the pandemic of COVID-19, I built up a website, “Awesome of COVID-19”, which collected the...原创 2020-05-08 04:58:00 · 771 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十一）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper1 Coding:1.负责任的可重复性计算机研究指南。reproducible research guidelines2.模拟数据并拟合2种物种的居住模型的代码。论文"A multispecies occupancy model for two or more interacting species"的代码实现。bayes2spe...原创 2020-04-24 07:32:19 · 3107 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八十）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper：1 Coding:1.城市模拟综合。UrbanSimulationSynthesis2.基于 bookdown 的 ElegantBook。ElegantBookdown3.R语言包lifecycle，生命周期提供了一组工具和约定来管理导出功能的生命周期。lifecycle4.学习GitHub注册的基础知识，进行首次回购，...原创 2020-03-25 06:01:10 · 789 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十九）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.图灵方式的主机存储库:如何引导一个可重复的数据科学项目。the turing way2.COVID-19新型冠状病毒的样本数据处理（R语言）。Coronavirus sample processing3.野火极端事件的时空模拟。wildfire extremes4.sqlite3的egg插件。e...原创 2020-03-20 08:03:15 · 938 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十八）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包tinyProject，R语言用户的轻量级数据分析框架。tinyProject2.全球变化评估模型（Global Change Assessment Model, GCAM）的共享经济路径（Shareing Socioeconomic Pathway, SSP）情景结果。ssp data3.线性...原创 2020-03-18 07:27:34 · 2019 阅读 · 3 评论 -
Coding and Paper Letter（七十七）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper：1 Coding:1.用于无服务器计算的安全快速微处理器。firecracker2.R语言包ggthemeassist，一个RStudio的Add-in插件用于调整ggplot2主题里的一些绘图细节（文字，边框，颜色）。ggthemeassist3.数据框概念的Matlab实现。DataFrame4.数据科学访谈的问题与回...原创 2020-03-08 23:13:01 · 1129 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十六）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.遥感变化检测相关资源。awesome remote sensing change detection2.计算机组成原理流水线资源。awesome pipeline3.R语言包salmix，用极大似然方法拟合时间序列数据的概率分布。salmix4.实现地球动图的代码与说明。earth atlas of...原创 2020-03-04 06:59:21 · 2269 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十五）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.在暑期课程学习后，实现芝加哥单车出租情况的可视化。Divvy可视化图片2.现代地统计数据分析——Rstudio 2020年会分会材料。geospatial3.ggplot2的相关资源整理。awesome ggplot24.Earthaxiv的一篇论文相关代码。题目为“The contribution...原创 2020-02-27 01:55:10 · 2834 阅读 · 0 评论 -
应用统计学与R语言实现笔记（番外篇二）——假设检验更正
今天的文章想从统计学的角度——假设检验，来回顾最近的疫情。同时也是刚好有之前应用统计学与R语言实现笔记假设检验一章中的的错误更正。关于假设检验的内容，详情见下面的博客。应用统计学与R语言实现学习笔记（六）——假设检验文章目录1 细心的读者与更正2 p值含义解读、假设检验结论与统计学决策3 放弃p值，yes or no？1 细心的读者与更正首先感谢简书平台上这位叫“十七颗青彩”的读者，她提出...原创 2020-02-21 01:45:03 · 792 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十三）
来荷兰以后第一次更文。还是熟悉的资源整理栏目！提前给大家拜个早年。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包rgee，Google Earth Engine的R接口。非官方库，从实现上来看，其实是借助R调用Python。rgee2.任何一个城市的道路可视化，在微博上已经先看到的一个可视化案例。数据来源OSM。city roads[外链图片转存失败,源站...原创 2020-01-21 00:07:50 · 1239 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十二）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.自动设置GOMAXPROCS以匹配Linux容器CPU配额。automaxprocs2.文言文編程語言。今天来自机器之心的推送，虽然我已经先看到了。来自CMU大四的大佬。wenyan lang3.此程序包中的文件采用云优化的GeoTIFF格式，可以在PROJ 7或更高版本的PROJ数据目录中解压缩。proj ...原创 2019-12-18 23:02:38 · 673 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七十一）
这个系列有点久没更新，最近事情比较多。后面会继续坚持资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包ggcorrplot2，ggplot2的拓展包，类似于corrplot包的功能，用于绘制相关系数图。在这个系列的第十七篇里有另一个相关的包，有兴趣的同学可以做下比较。ggcorrplot22.R代码的分析，可重现研究与审查。CodeDepends3....原创 2019-12-14 00:54:38 · 1125 阅读 · 2 评论 -
带南海九段线分位数地图可视化（R语言版）
今天带来一篇承诺虾神的可视化博客。内容是使用R语言进行带南海九段线分位数地图可视化。虾神的原博文地址如下（Python版）。Python实现带南海九段线分位数地图完整可视化版本（附代码及数据）1999-2017年中国各省旅游外汇收入分析及可视化（附代码及数据）数据及代码github地址文章目录1 数据下载1 git clone2 直接下载（Download ZIP）2 R语言可视化1 所需...原创 2019-11-13 01:34:50 · 4774 阅读 · 1 评论 -
Endnote使用小记
如何高效快速管理阅读的文献是研究生学习中的第一步。这里就推荐下目前正在使用的Endnote（当然还有其他平台，这里就对我用的Endnote重点介绍下）。这里提三个简单的功能小记。原创 2017-11-20 22:08:04 · 4739 阅读 · 0 评论 -
迟来的2017总结文
悄然过去的2017年，仿佛还来不及说再见。突然想起那天科比球衣退役时热泪盈眶地在宿舍看直播的自己。默默做个总结来迎接新的一年。2017年走过的城市还蛮多的。一年下来，半年北方，半年小厦门。参加的学术活动也算不少，也算有些小成果。不过我想这一年来在github和博客上确实花了不少功夫，对于开源、编程，自己也有了更深入的了解。2017年博客一共发了44篇博客，第一次利用github搭建了自原创 2018-01-10 22:43:31 · 568 阅读 · 0 评论 -
MODIS数据的简介和下载（番外篇）——MODIS Web Service的Python客户端应用
新年开坑第一篇，关于之前MODIS系列博客的补充和番外篇。有兴趣的同学可以去翻阅前面的文章复习。MODIS数据的简介和下载（一）——MODIS数据简介MODIS数据的简介和下载（二）——MODIS数据下载方式（FTP）MODIS数据的简介和下载（三）——MODIS数据下载方式（基于MODIS Web Service）之前有小伙伴在评论区问过我，说Matlab客户端不能用了，前一段笔原创 2018-01-18 14:46:28 · 3657 阅读 · 5 评论 -
R语言高清图片输出设置
以ggplot2等包为基础的R语言可视化是科研人员非常喜爱的一个方式，不过我也在这个上遇到了些问题。就是导出高分辨率的图片之后，插入到word里，就显得模糊不清（压缩得非常厉害）。如果不压缩的话，word动辄100M以上。最近刚好有了一个解决方式，就来介绍下。解决方案思路：R+Corel Draw这也是某期刊图的修改要求，必须提供.cdr文件。当然测试后发现，.cdr输出的tif即使被...原创 2018-03-15 00:42:29 · 33899 阅读 · 0 评论 -
天不生Tobler，万古GIS如长夜
今日在QQ上惊闻Waldo Tobler老先生已于昨日过世，实乃地理学界的一大憾事，特地以此文表示深切的悼念。（一）Waldo Tobler，生于1930年，圣塔芭芭拉加州大学（UniversityofCalifornia,SantaBarbara，简称UCSB，又常译为加州大学圣塔芭芭拉分校）退休教授，美籍瑞士地理学家，制图学家。下图的帅哥就是老爷子（文字介绍来自百度百科，图片来自维基百...原创 2018-02-22 21:28:51 · 1978 阅读 · 0 评论 -
MODIS数据的简介和下载（六）——基于浏览器模拟登陆下载的方式以及D3L Tool开发
接上文，由于NASA官方弃用了FTP改用HTTPS服务，所以关于MODIS数据的下载方式有所改变。完整系列博客可以参照以下链接。本篇主要介绍的是我自己写的一个下载方式，以及我为了方便大家下载开发的一个带图形界面的下载工具。MODIS数据的简介和下载（一）——MODIS数据简介MODIS数据的简介和下载（二）——MODIS数据下载方式（FTP）MODIS数据的简介和下载（三）——MODI...原创 2018-05-18 16:03:39 · 1216 阅读 · 12 评论 -
R语言字符串处理的一次经历
最近笔者在研读一些文献，发现了Remote Sensing of Environment上的一期Special Issues。这一期可以说是地学上Data Assimilation较为经典的研究吧。所以也是目前研读的重点。当然也是有些其他需求，现在想对这一期专刊的作者与客座编辑做些分析探讨。涉及到一些R语言的字符串处理方式。这里记录下。1 数据描述2 问题描述与思路3 R语言实现...原创 2018-06-05 14:58:36 · 625 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（二）
资源整理。1 Coding：2 Paper:1 Coding：1.近期高光谱遥感的论文和开源代码。LandcoverClassification_BaselineEvaluation GitHub基于高光谱数据对土地覆被进行分类的代码。Matlab code for hyperspectral image classification based on JSaCR ...原创 2018-07-08 16:30:19 · 625 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（三）
资源整理。1 Coding：2 Paper:1 Coding：1.变化检测专题。Change-Detection-in-Remote-Sensing-Images遥感影像变化检测的Python代码。change-detection-tutorial时间序列数据的变化检测。SAR-change-detectionSAR影像的变化监测。demeter土地利用土地...原创 2018-07-09 22:17:50 · 1056 阅读 · 2 评论 -
Coding and Paper Letter（四）
资源整理。1 Coding：2 Paper:1 Coding：1.与Ecological Forecast这本书以及研究生相关的实践活动。EF_Activities2.h2o的R示例，h2o是一个机器学习的平台。h2o-r-examples3.R语言包rnassqs，是NOAA快速API的R接口。rnassqs4.Python模块spatiallis...原创 2018-07-10 15:24:53 · 485 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（七）
资源整理1 Coding：1.R语言包smapr，用于获取和处理NASA SMAP数据的R包。NSIDC提供多个SMAP数据产品，这些产品的处理量各不相同。 目前，smapr主要支持3级和4级数据产品，分别代表全球每日复合和全球三小时模型数据产品。 包括了多个分辨率的土壤湿度和NEE产品。smapr2.开源项目Big Data，该项目涉及如何使用Apache Spark执行时空...原创 2018-07-16 21:36:54 · 847 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（五）
资源整理1 Coding：1.Python模块libpysal，pysal的核心组件。与pysal的区别目前没有明确。有空研究一下。功能都是Python空间分析的模块。libpysal2.R语言包mongrel，多项逻辑斯蒂-正态线性回归模型。mongrel3.R语言工程SLATRRA——Satellite Latency Assessment Tools for Re...原创 2018-07-11 22:16:28 · 431 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（八）
资源整理1 Coding：2 Paper：1 Coding：1.Python项目，由Allen Downey撰写的Think Python第二版的LaTeX源代码和支持代码。ThinkPython22.R语言包h3jsr，h3jsr使用V8的神奇力量通过其javascript绑定提供对Uber H3库的访问。 h3jsr3.Python项目roi poo...原创 2018-07-18 22:16:22 · 611 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（一）
最近发现需要在快速阅读背景下，对快餐式资源做整理与收集。以Coding（以Github）和Paper（自己看到的一些论文，论文一般主要看题目和摘要做些简单小结）的资源为主。1 Coding：2 Paper:1 Coding：1.QGIS上的变形地图插件，我后面会专门来介绍变形地图这个主题的内容。qgis-cartogram源码2.火星坐标与地球坐标转换开源代码。...原创 2018-07-07 12:59:30 · 496 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（六）
资源整理1 Coding：2 Paper:1 Coding：1.Python工程，使用networkx，geopandas，mplleaflet在地图上可视化网络流。map-network2.R语言包rsample, 用于创建和汇总不同类型的重采样对象的类和函数。rsample3.R语言包lomm，lomm软件包为透明且可重现的工作流程，获取和处理空间（...原创 2018-07-13 16:34:47 · 518 阅读 · 0 评论 -
Coding and Paper Letter（九）
资源整理1 Coding：2 Paper:1 Coding：1.高光谱遥感相关代码资源。Sensor Specific Hyperspectral Image Feature Learning利用卷积神经网络学习高光谱图像传感器特有的空间谱特征。Hyperspectral Image Spatial Super Resolution via 3D Full Conv...原创 2018-07-20 15:42:25 · 631 阅读 · 0 评论