![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756916.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
生信
Esctrionsit
同步blog。Github:https://github.com/esctrionsit
展开
-
GWAS学习笔记(一):质量控制(QC)
本系列文章采用的数据集与代码来自https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial。该教程获得了许多人的推荐,是一份很详细的step-by-step guide。本文将介绍该教程中的QC部分(1_QC_GWAS.zip),后续或将继续添加有关QC的其他细节。0. 目录1. 准备2. 数据简介3. 分析步骤第1步:SNP缺失率过滤第2步:检测、过滤性别差异第3步:次等位基因频率(MAF)过滤第4步:删除不符合Hardy-Weinberg平衡的SNP第5步:控制杂合率.原创 2020-08-01 14:26:52 · 6824 阅读 · 0 评论 -
hmmlearn使用简介
隐含马尔可夫模型(Hidden Markov Model,HMM)最初是在20世纪60年代后半期,由Leonard E. Baum和其他一些作者在一系列统计学论文中描述的。其最初应用于语音识别领域。1980年代后半期,HMM开始应用到生物序列,尤其是DNA序列的分析中。随后,在生物信息学领域,HMM逐渐成为一项不可或缺的技术。本文内容包含来自:[1] 用hmmlearn学习隐马尔科夫模型HMM[2] 官方文档0. 目录1. hmmlearn2. MultinomialHMM2.1 定义、使用原创 2020-08-01 14:18:37 · 6979 阅读 · 8 评论