[Linux|生信]project4_01:批量下载sra文件并转化为fastq文件
背景最近参加“生信技能树”组织的实习,要求完成从*.sra原始数据出发完成人类单细胞转录组数据下载、质控过滤、Hisat2比对、featureCounts定量的任务。接下来一段时间会出一个小系列。几年前在学校的生信课上分析了一个完整的Chip-Seq流程,当时对很多概念一知半解,这次借着这个机会再回头打打基础。数据下载环境准备首先安装一个conda虚拟环境并更换镜像(下载国外资源更方便),见文末参考链接# 下面四行配置北京外国语大学的conda的镜像# 配置完需要重启终端c
原创
2022-12-05 19:44:56 ·
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