AI夏令营生命科学赛道siRNA药物药效的预测笔记一

1.跑通baseline与环境的搭建

前言

在学习过程中,我们首先做的第一件事情就是跑通baseline这样我们才能收集到模型训练的数据并提交至赛题的官网获得分数。

step 1      启动魔塔的GPU环境

1.魔塔GPU的链接:https://modelscope.cn/my/mynotebook/preset

2.进入魔塔后我们需要创建自己的虚拟环境如下图

step 2        跑通baseline

3.我们成功进入到了魔塔环境中下载测试文件和数据,根据图中的步骤上传下载的测试文件和数据

• 模型训练的代码脚本文件

• 训练模型所用到的数据集(赛题指定数据集)

4.进入终端

4.解压数据集

复制下面的命令，粘贴在终端处并回车运行

unzip siRNA_0715.zip

 以下文件出现在目录中解压成功

 5.打开名为 task3.2_siRNA.ipynb的文件并运行代码

6.运行成功后下载submission.csv的结果文件

7.运行结束后我们需要关闭实例环境，因为魔搭Notebook会在没有后续操作的1小时后自动关闭，仅保存 notebook 文件。如果你有其他任何需要保存的文件，请提前下载保存到本地。

step 3 进入官网赛道提交数据

链接：http://competition.sais.com.cn/competitionDetail/532230/mySubmissions

总结

根据学习手册的内容跑完了baseline，虽然还没有学习相关的优化使得自己的分数变高，但已经熟悉了具体的环境流程这为后续的学习和环境的测试提供的帮助。