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原创 bwa mem比对结果错误,sam文件不能被samtools识别的原因之一

解决[M::bwa_idx_load_from_disk] read 0 ALT contigs的问题总结如下,bwa mem比对结果错误,sam文件不能被samtools识别的原因之一是bwa安装的问题!写这个初级的帖子,为后来人遇到同样问题的人,在百度搜索的时候能够找到能解决问题的帖子!

2017-09-21 18:15:30 7652 5

原创 sam to bam文件出错

开始学习生物信息分析,在ubuntu上运行了samtools view,结果显示错误,如下:# samtools view -@ 60 -bS *.sam > ra24p.bam[samopen] no @SQ lines in the header.尝试改变参数也不行就查看了sam文件#head -10 ra24p.sam[M::bwa_idx_load_

2017-08-18 10:39:23 9039 3

空空如也

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