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转载 <二代测序> 批量下载 NCBI sra 文件
本文最近更新地址: http://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/51078460前文 http://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/51077222 介绍了如何采用 sra-toolkit 下载 sra 文件,但是如果你想下载整个项目的所有样本,应该怎样批量下载呢,下面参考
2016-10-30 21:17:57 1202
转载 Ubuntu Linux安装配置Pycharm
一、安装配置JDK1、到oracle的官网下载http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html 选择 accept license ,然后选择适合自己机型的JDK下载。 2、解压文件,修改文件名 sudo mkdir /usr/lib
2016-10-29 21:24:48 733
转载 Linux使用小技巧
Ubuntu应用程序创建桌面快捷方式 一、第一种方式1. 安装必要软件 gnome-panel sudo apt-get install --no-install-recommends gnome-panel [python] sudo apt-get install --no-install-recommends gnome-panel 2. 开始创建桌面快
2016-10-27 19:23:08 273
转载 BLAST+使用方法
BLAST+与BLAST相比,有很多改进和提高,NCBI强烈推荐放弃BLAST,使用BLAST+, 这里说的BLAST和BLAST+,都是本地的,与之前的那个批量BLAST小程序不是一回事。BLAST下载地址:NCBI BLAST+ 。BLAST+的一般用法如下:格式化数据库makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -parse_seqids
2016-10-27 14:49:12 10306
转载 Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程
本文提供在Linux系统中进行NCBI BLAST+本地化的方法。实测环境为Linux64位系统,无ROOT权限。本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用),高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法,一是因为思路一样,二是因为Linux中BLAST效率更高,系统更稳定,不会卡死。所以,请用Linux服务器,我想你也不忍心让自己心爱的本本跑几十个小时的程序吧。请不要因为篇
2016-10-27 14:43:06 31030 3
原创 Linux基础知识(一)
一、两个文件的交集、并集(前提条件:每个文件中不得有重复行)1. 取出两个文件的并集(重复的行只保留一份) cat file1 file2 | sort | uniq > file32. 取出两个文件的交集(只留下同时存在于两个文件中的文件) cat file1 file2 | sort | uniq -d > file33. 删除交集,留下其他的行 cat file
2016-10-27 10:21:57 396
转载 Linux安装搜狗输入法
在Ubuntu Kylin系统中,默认安装搜狗拼音输入法,但是在原生Ubuntu系统中则不是。这可以理解,毕竟搜狗输入法的Linux版有Kylin团队的不小功劳。由于搜狗输入法确实比Linux系统下其它的中文输入法都要好用得多,所以我决定在我的Ubuntu 14.04系统中安装搜狗输入法。 必需得科普一下的是,Linux系统下的输入法都是建立在输入法框架之上,先有输入法框架,再有具体
2016-10-23 13:51:28 944
原创 虚拟机VMware中使用Ubuntu连网
虚拟机VMware中使用Ubuntu连网一、主机有线上网1.首先完全关闭ubuntu;2.打开虚拟机,找到unbutu,右键“设置”,如图所示。3.然后点“网络适配器”,如图所示4.打开Ubuntu应该就可以上网了。二、主机无线上网1.同样是首先完全关闭ubuntu;2.还是找到unbutu,右键“设置
2016-10-21 17:24:52 894
转载 MAFFT多重序列比对图解教程
【絮语】 一提到多重序列比对,很多人禁不住就想到ClustalW(Clustalx为ClustalW的GUI版),其实有一款多重序列比对软件-MAFFT,不论从比对速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),还是比对准确性(MAFFT>Muscle>T-Coffee>ClustalW)来说,其相比于ClustalW(或ClustalX)有过之而无不及,所
2016-10-20 14:47:04 10781
转载 《HP大中华区总裁孙振耀退休感言》
一、关于工作与生活我有个有趣的观察,外企公司多的是25-35岁的白领,40岁以上的员工很少,二三十岁的外企员工是意气风发的,但外企公司40岁附近的经理人是很尴尬的。我见过的40岁附近的外企经理人大多在一直跳槽,最后大多跳到民企,比方说,唐骏。外企员工的成功很大程度上是公司的成功,并非个人的成功,西门子的确比国美大,但并不代表西门子中国经理比国美的老板强,甚至可以说差得很远。而进外企的人往往
2016-10-08 15:49:40 465
机器学习实战及配套代码
2016-04-06
Python学习手册(第3版).pdf
2016-04-04
空空如也
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