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立身以力学为先,力学以读书为本。 —郑耕老《劝学》

是故无冥冥之志者,无昭昭之明;无惛惛之事者,无赫赫之功。 —荀子《劝学》

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转载 如何用R画折线图,散点图,平滑曲线图

如何用R画折线图,散点图,平滑曲线图例子:week123456x38192461y125

2017-04-30 21:34:26 46084 2

转载 R作图控制坐标轴刻度的个数和标注

控制坐标轴中刻度的个数,方向,刻度的标注,以及刻度的标注用到plot()中的xaxt,yaxt和axis低绘图参数等。这里面就不贴图了,自己用R界面试试就出来了。 1.R自动刻度>x=seq(1,10)>y=x>plot(x,y)  #会发现自动生成了5个刻度,而且每个刻度都标注了数字  2.控制不显示刻度  

2017-04-30 21:32:35 9090

转载 plot图画多条折线图,如何把所有的折线都包含在图中呢(坐标轴范围如何设置)

plot图画多条折线图,如何把所有的折线都包含在图中呢(坐标轴范围如何设置)COS论坛 | 统计之都 › COS论坛 | 统计之都 › 软件应用 › S-Plus & R语言 › plot图画多条折线图,如何把所有的折线都包含在图中呢(坐标轴范围如何设置)该主题包含 4 条回复,2个帖子,最后由  daigazi 在 4 年, 5 月 之前 更新。

2017-04-30 21:30:12 12399

转载 Java enum的用法详解

用法一:常量在JDK1.5 之前,我们定义常量都是: public static fianl.... 。现在好了,有了枚举,可以把相关的常量分组到一个枚举类型里,而且枚举提供了比常量更多的方法。public enum Color { RED, GREEN, BLANK, YELLOW }  用法二:switchJDK1.6之前的switch语

2017-04-27 16:17:13 255

转载 python操作excel表格(xlrd/xlwt)

最近遇到一个情景,就是定期生成并发送服务器使用情况报表,按照不同维度统计,涉及python对excel的操作,上网搜罗了一番,大多大同小异,而且不太能满足需求,不过经过一番对源码的"研究"(用此一词让我觉得颇有成就感)之后,基本解决了日常所需。主要记录使用过程的常见问题及解决。  python操作excel主要用到xlrd和xlwt这两个库,即xlrd是读excel,xlwt是写excel

2017-04-27 14:38:07 834

转载 R语言中因子(factor)转换成数值型(numeric)的问题

一直觉得只要是数字,不管是什么类型的,都可以通过as.numeric()函数转换为对应的numeric类型的数字,例如x<-“123”,x为character类型,而as.numeric(x)则为numeric类型的123。但是因子(factor)类型却不一样。 a<-factor(c(100,200,300,301,302,400,10)),它们的值分别为100 200 300 30...

2017-04-19 17:53:49 19326

转载 R语言︱线性混合模型理论与案例探究(固定效应&随机效应)

线性混合模型与普通的线性模型不同的地方是除了有固定效应外还有随机效应。笔者认为一般统计模型中的横截面回归模型中大致可以分为两个方向:一个是交互效应方向(调节、中介效应)、一个是随机性方向(固定效应、随机效应)。两个方向的选择需要根据业务需求:交互效应较多探究的是变量之间的网络关系,可能会有很多变量,多变量之间的关系;而随机性探究的是变量自身的

2017-04-13 13:15:51 4553

转载 主成分分析和主成分回归

主成份分析是对数据降维的方法,通过从数据中抽提少数的主成份来近似代表数据。选择主成份是根据数据的方差来进行的,每次选择的主成份都是数据中方差最大的方向,并且主成份之间不相关。求主成份的两种方法:1 从变量构成的矩阵X出发,先求出t(X)X的特征值和特征向量,然后用X乘以特征向量就得到了主成份2 从矩阵X的相关矩阵出发,求相关矩阵的特征值和特征向量,然后用归一化的X乘以特征向量得到了

2017-04-12 19:44:18 26735 1

转载 在国外做科研与在国内做科研的对比

笔者在北京的科研院所读了三年的研究生,之后来到澳洲科廷大学攻读博士,根据这边的见闻与感受,拙笔做了一篇关于国内外科研环境的对比,欢迎大家来探讨,有不全片面偏激之处,还请多包涵。        国外做科研首先有一条,就是自由,事儿少。国内的时候,大家很躁,因为动不动就得去报账、取材料、领导来了开会、倒茶、准备材料,精力都被琐事耗散掉了,留给科研的时间不多。老师也很辛苦,通

2017-04-10 21:48:50 4373 1

转载 R语言中的机器学习

Machine Learning & Statistical Learning (机器学习 & 统计学习) 网址:http://cran.r-project.org/web/views/MachineLearning.html维护人员:Torsten Hothorn 版本:2008-02-18 18:19:21 翻译:R-fox, 2008-03-18 机器学习是计算机科学

2017-04-10 16:37:16 805

转载 关于聚类的一些经验及其在R中的实现

1 首先针对数据进行分析,回答下面的问题:1)想用聚类方法解决什么问题。是想看数据的结构,还是想把数据分为很多类,还是有其他的目的。2)数据本身的分布。针对样本聚类还是针对变量聚类?样本可能符合怎样的分布?变量又会符合怎样的分布?2 选择合适的聚类方法针对聚类目的和数据的分布,选择合适的方法。一般来说,层次聚类比较适合用来分析数据的结构,因此可以用来做初步的聚类,从

2017-04-10 16:30:44 4356

转载 非常快速而且能够处理成千上万条序列的建进化树软件FastTree

之前推荐过但是当时自己没有用过,现在尝试了一下,发现确定非常快。拿我的问题来说,总共3000多条序列,序列长度为1700nt,我用Phylip中最快的的Neighbor-joining计算花了一个小时以上,而且是在我的主机,而用我装的虚拟机(内存500M,计算能力肯定不能主机)FastTree计算,只花了不到20分钟,而且更强悍的是它还给出了每个节点的可信度(local support val

2017-04-10 16:15:51 7478 1

转载 从NCBI批量下载序列

Three easy ways to download multiple sequences from NCBIThere are different ways of how to download multiple sequences from the NCBI databases in a single request. 1) Using the batch Ent

2017-04-10 16:12:19 4772

转载 linux中cat、more、less、tail、head命令的区别

一、cat 显示文件连接文件内容的工具 cat 是一个文本文件(查看)和(连接)工具,通常与more搭配使用,与more不同的是cat可以合并文件。查看一个文件的内容,用cat比较简单,就是cat后面直接接文件名。 如:root@ubuntu :/# cat /etc/passwd   1、cat 语法结构: cat [选项] [文件]...   选项 

2017-04-10 10:42:34 443

转载 numpy的ndarray与pandas的series和dataframe之间互转

在大数据分析中,比较常用的两个数据分析包就是numpy和pandas,而pandas正是基于numpy构建的含有更高级数据结构和工具的数据分析包,在金融领域应用更是广泛。在实际的工程中,经常遇到的问题就是numpy的ndarray数据结构与pandas的series和dataframe数据结构之间的互相转换问题。现在我分3种情况,在python程序中列一下互转的情况,应该比较全面了。情况1

2017-04-06 13:28:02 89693 6

转载 卡内基梅隆大学Wasserman教授的统计学理论与机器学习三部曲教材

卡内基梅隆大学Larry Wasserman教授 统计学理论及机器学习与数据挖掘三部曲教材 数据可以在作者主页下载 http://www.stat.cmu.edu/~larry/统计学完全教程 张波译 All of Statistics by Larry Wasserman http://mathsccnu.gotoip11.com/forum.php?mod=viewthread&tid

2017-04-06 11:38:19 2014

转载 统计系本科生参考书整理

推荐的书单包括统计系本科生课程密切相关的中文书籍或者中译本:统计历史,统计学入门(非数学专业的统计书),数学分析,线性代数,概率论,数理统计,随机过程,R语言,大数据,金融统计,金融数学,生存分析,寿险精算,精算与风险模型。入选的标准是最近出版的书,而且最好有完整习题答案或者辅导书,利于自学。希望国内的初学者多看一些国内外大师(国内是院士级别,国外的学者是资

2017-04-06 11:35:53 2337

转载 RStudio改变工作路径

1.用命令getwd() 获取当前工作路径setwd()设置工作路径需要注意的是:linux下相对路径 setwd("./Rsourse")上一级目录serwd("../")绝对路径setwd("/Users/renlan/data")windows下 相对路径setwd(".\\Rsourse") 上一级目录setwd("..\\") 绝对路径set

2017-04-05 19:26:03 7832

原创 Ubuntu下安装了Anaconda后无法导入第三方库的解决方法

Ubuntu系统已经安装了python,我们可以安装诸如numpy,scipy,pandas等第三方库以便使用,我们可以在终端输入python,然后输入import  numpy等,然后使用这些第三方库。Anaconda 是 Python 科学技术包的合集,功能和 Python(x,y) 类似。它是新起之秀,已更新多次了。包管理使用工具conda,GUI基于PySide,容量适中,但该有的科学计算...

2017-04-03 16:10:37 7430

转载 ubuntu下修改环境变量以及添加PYTHONPATH方法

Ubuntu下设置环境变量有三种方法,一种用于当前终端,一种用于当前用户,一种用于所有用户: 一:用于当前终端:在当前终端中输入:export PATH=$PATH:不过上面的方法只适用于当前终端,一旦当前终端关闭或在另一个终端中,则无效。  export NDK_ROOT=/home/jiang/soft/Android-ndk-r8e #只能在当

2017-04-03 15:52:15 3823

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