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读入文件：x = read.table("", as. is = T, head = T)#读入文件，as.is = T整体, head = T, 有标题行x$#输出这一列x[1:10, ]#输出x的1到10行，所有列x[1:10, 1:3]#输出x的1到10行，1到3列#R从1开始计数安装包install.packages("")
2011-12-21 09:32:00
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原创 安装R语言及R与python接口Rpy
安装R，现在R已经集成，用apt-get install语句即可，当然，需要管理员权限sudo apt-get install r-base 该语句将完整的安装R语言包，如需与python联动需安装r-devsudo apt-get install r-dev安装rpysudo apt-get python-rpy2检测是否成功$ python>>>
2011-12-20 15:07:59
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原创 win32系统下配置svm及python接口
svm的安装：1 下载libsvm压缩包解压到C盘2 安装python3 下载gnuplot压缩包解压倒C盘修改环境变量，将以上三个软件的exe文件所在文件夹添加到PATH，重启。测试：在libsvm/tools路径输入python easy.py train.1 test.1其中train.1 test.1是数据集看到往外弹gnuplot的图片就成功python接口编译python接口需要调用c编译器，可以用vc，我使用了minGW1 安装minGW，下载minGW安装文件，最新版本不好用，我下载了之前版
2011-02-24 15:42:00
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原创 shell命令基础
shell基础shell：外壳，用户通过shell和系统内核发成交互，是用户和计算机交互的界面。shell分类：命令行、图形终端shell的版本： more /etc/shell 显示目前可用的所有shell版本 echo $SHELL 查看当前shell版本 echo $0 同上 sh（其他shell名） 转换到其他shell版本 exit
2010-03-31 13:01:00
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原创 血泪安装stata10
首先是下载问题，在veryCD找到了源，这个搜一下就好了，而且已经下好，留用～～然后就是要在linux下面挂在这个带bin带cue类型的光盘镜像这个类型不能直接挂载，要转换：sudo apt-get install bchunk新建一个光驱文件夹mnt到文件系统，新建一个安装文件夹sudo mkdir /usr/local/stata10并且赋予755权限chmod 7
2010-03-11 22:03:00
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原创 研究准备（3） 安装RNAfold
RNAfold是在维也纳软件包中的，要使用的话，需要从源码开始编译解压软件包打开终端，并且进入文件夹之后输入./configmakesudo make install这样就ok了，再打开终端输入RNAfold就能进行RNA折叠了～～hoho～～一切准备就绪，开始运行程序～～
2009-12-18 15:48:00
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原创 研究准备（2） 安装libsvm
说到libsvm，我们之前已经进行过系统安装了，为啥还要再安装呢？～ 因为libsvm有python模块，按照python模块的安装，就可以在python语言中方便的引用了～因此python安装libsvm，步骤如下： 打开终端：cd ‘/libsvm-**/pythonpython setup install好像pygr也是这么干的，呵呵～～
2009-12-18 15:43:00
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原创 研究准备（1）安装pygr
师弟写的程序依赖众多其他软件，于是一个一个安装，一个一个写：pygr: A python graph framework for highly scalable comparative genomics and annotation database analysis它集成了很多生物信息学工具，应该是玩生物信息学的人要掌握的，可是我到现在才发现…………惭愧阿…………不过blast就更惭
2009-12-16 15:38:00
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原创 firefox玩开心农场
恩，之前firefox一直没法玩开心农场，也不能背单词究其原因，还是flash插件的问题一开始提示要安装flash的时候选择了第一个插件于是很多flash都不能正常播放ft你不好好工作居然还能派第一 解决方法如下首先打开新立得软件包管理器选择已安装搜索flash然后把swf的那个flash标记为卸载点击应用就卸载完毕了 重新打开firef
2009-09-25 11:47:00
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原创 linux下装QQ，64位系统
呃，本来是很简单的事情，却被弄得如此复杂，都是因为没有调查清楚，直接装了个64位的系统…………如果重新装系统的话，一定装个32位的 所以首先要装32为库文件sudo apt-get install ia32-libs lib32asound2 然后从官方网页下载qq的deb包 接下来强制安装dpkg -i --force-architecture *.deb
2009-09-25 11:31:00
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原创 gnuplot使用技巧（转载）
对于在Linux下工作的人，如果你经常要画一些二维图和简单的三维图的话，那么，gnuplot无疑是一个非常好的选择，不仅图形漂亮，而且操作简单。当然如果需要质量更高的三维图，请用其他的一些专业绘图软件。建议大家学会使用gnuplot。这个小软件通常都是RedhatLinux自带的，但自带的版本是3.7的，建议将其升级到4.0，新版本具有很多新功能
2009-09-04 21:06:00
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原创 安装gnuplot
gnuplot是科学绘图软件，也是我在linux下装的出了mystar之外的第一个软件安装过程如下： 终端中输入：sudo apt-get install gnuplot然后再输入密码就能开始装了，我也不知道为啥他能自己装，这个命令好神奇阿，都不用指定路径么～～ 接下来我就选择了更新，在接下来就是漫长的等待了…………～～ ok，很简单嘛～～
2009-09-04 20:09:00
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翻译 LIBSVM
LIBSVM是台湾大学林智仁(Lin Chih-Jen)副教授等开发设计的一个简单、易于使用和快速有效的SVM模式识别与回归的软件包，他不但提供了编译好的可在Windows系列系统的执行文件，还提供了源代码，方便改进、修改以及在其它操作系统上应用；该软件还有一个特点，就是对SVM所涉及的参数调节相对比较少，提供了很多的默认参数，利用这些默认参数就可以解决很多问题；并且提供了交互检验(Cross V
2009-08-27 15:27:00
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原创 校园认证mystar安装
第一次安装的时候还比较顺利的，不知道为啥后来只能手动安装，不过还好，手动安装也并不难：我的安装流程如下 sudo cp ‘./mystar（填mystar所在路径，或者拖进终端就好了） /usr/bin/mystarchmod +xs /usr/bin/mystar (赋予mystar可操作权限，并可在任意目录下运行） 填写好mystar.conf文件然后 sud
2009-08-27 13:05:00
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原创 wubi安装ubuntu9.04具体流程（血泪版）
总是出现95%语言包错误，重装了好几次才搞定~ 下载wubi并运行 选择英语，创建用户开始下载 重启，拔网线，启动选择ubuntu开始装系统 基本完全自动，当进度到95%时，开始安装语言包，卡住后如下操作：按下Ctrl+Alt+F2，进入命令行界面，手动输入以下命令sudo ps aux | grep -v grep | grep /usr/bin/pyth
2009-08-27 12:59:00
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原创 目前想学习的
SPSS今天的学习表明，我要么不能用汉化，要么重新下一个版本，不然就无法做T检验了 python和perl一样属于脚本语言，执行速度和系统语言相比有差距，完全的面向对象语言，擅长处理琐碎小事，真是我需要的，而perl则擅长处理文本，好像也需要多学习一下下~ svm目前只清楚原理，还啥都不懂~ 还有应该多阅读下文章。 PS：电信网上csdn挺快的，为啥教育
2009-01-18 16:04:00
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原创 手动杀病毒Logo1_.exe，rundl132.exe
中了这个可恶的木马，怎么杀都没搞定，当然没有试一下360的顽固木马软件，现在手工把他干掉了，感谢百度，感谢论坛。 首先说一下中毒之后的情况，QQ不停的报有木马，而且QQ医生已经被屏蔽，下了360，不停的扫描，查杀、修补漏洞，重启，还是出现病毒，就是在c:/windows下两个文件：Logo1_.exe，rundl132.exe，还有0sy.exe到9sy.exe好多
2008-07-23 14:02:00
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生物信息编程使用python
2010-03-17
空空如也
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