研究准备（1）安装pygr

师弟写的程序依赖众多其他软件，于是一个一个安装，一个一个写：

pygr: A python graph framework for highly scalable comparative genomics and annotation database analysis

它集成了很多生物信息学工具，应该是玩生物信息学的人要掌握的，可是我到现在才发现…………惭愧阿…………

不过blast就更惭愧了，无言以对，不管了，现在开始学习也来得及！！

 

安装过程：

1 安装python

   基于python的工具，当然首先要安装python，ubuntu是集成了python的，所以不安装

 

2 安装pyrex

   这个是什么东东我都不清楚，反正是跟编译器有关的，在这个链接进行下载

   http://www.cosc.canterbury.ac.nz/greg.ewing/python/Pyrex/

   然后解压根据install.txt中的提示，首先

   tar Pyrex-0.9.8.5.tar.gz

   然后

   cd ‘Pyrex-0.9.8.5/'

   接下来

   sudo python setup.py install

   这样就算安装搞定

 

3 安装C编译器

   ubuntu下C编译器就用GCC

   安装这个比较方便

   sudo apt-get install gcc

   这样就ok了

   但是还有一个大麻烦，我就折腾了好久都是这个地方出问题：