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原创 用R中的包实现逐步回归
逐步回归逐步回归三种策略计算逐步回归MASS包的stepAIC()方法leaps包的regsubsets()方法caret包的train()方法逐步回归三种策略1.前向选择从模型中没有预测变量开始,迭代地添加最多的贡献预测变量,并在改进不再具有统计显着性时停止。2.向后选择(或向后消除),从模型中的所有预测变量(完整模型)开始,迭代地移除最少的贡献预测变量,并在您拥有所有预测变量具有统计显着性的模型时停止。3.逐步选择(或顺序替换),这是前向和后向选择的组合。从没有预测变量开始,然后依次添加最有
2020-06-29 10:39:10 6824
原创 R语言实现前向逐步回归(前向选择模型)
R语言实现前向逐步回归前向逐步回归原理数据导入并分组导入数据特征与标签分开存放前向逐步回归构建输出特征集合从空开始一次创建属性列表模型效果评估前向逐步回归原理前向逐步回归的过程是:遍历属性的一列子集,选择使模型效果最好的那一列属性。接着寻找与其组合效果最好的第二列属性,而不是遍历所有的两列子集。以此类推,每次遍历时,子集都包含上一次遍历得到的最优子集。这样,每次遍历都会选择一个新的属性添加到特征集合中,直至特征集合中特征个数不能再增加。数据导入并分组导入数据,将数据集抽取70%作为训练集,剩下30%
2020-06-29 09:55:29 7097
原创 R的randomForestSRC包做生存分析(用随机生存森林做生存分析)
用R的randomForestSRC包做生存分析用randomForestSRC做生存分析导入randomForestSRC包准备生存分析的数据构建模型,进行生存分析绘图用randomForestSRC做生存分析导入randomForestSRC包在R中的实现如如下图所示准备生存分析的数据在R中的实现如下图所示在上图中,data_express即是我们要进行生存分析的数据,数据共有411个样本。构建模型,进行生存分析在R中的实现如下图所示绘图在R中的实现如下图所示绘图结果如下
2020-06-27 15:51:50 12781
转载 转载-LaTeX实战经验:从零开始快速入门
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2019-08-28 10:00:11 383
原创 NCBI数据下载-sra
NIBI数据下载-sraNCBI数据下载步骤进入NCBI选择需要的数据选择需要的数据查看数据相信信息点击数据连链接,进入下载页面下载并安装SRA ToolkitNCBI数据下载步骤NCBI具有强大的功能,今天就sra数据下载为例进行简单的介绍进入NCBI百度NCBI官网,点击进入,或者直接搜索链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/选择需要的数据如下图所示,这里...
2019-08-01 18:08:14 713
翻译 马修斯相关系数MCC和标准互信息NMI
1 机器学习知识补充机器学习分为三个阶段:第一阶段:学习模型。采用学习算法,通过对训练集进行归纳学习得到分类模型。第二阶段:测试模型。将已经学习得到的分类模型用于测试集,对测试集中未知类别的实例进行分类。第三阶段:性能评估。只有通过优秀的评价标准才能选择出性能更好的分类器。2.马修斯相关系数(性能评估的指标). 马修斯相关系数是应用在机器学习中,用以测量二分类的分类性能的指标...
2019-07-23 12:26:00 6648
Linux的虚拟环境cygwin64
2015-12-29
空空如也
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