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用R中的包实现逐步回归
逐步回归逐步回归三种策略计算逐步回归MASS包的stepAIC()方法leaps包的regsubsets()方法caret包的train()方法逐步回归三种策略1.前向选择从模型中没有预测变量开始,迭代地添加最多的贡献预测变量,并在改进不再具有统计显着性时停止。2.向后选择(或向后消除),从模型中的所有预测变量(完整模型)开始,迭代地移除最少的贡献预测变量,并在您拥有所有预测变量具有统计显着性的模型时停止。3.逐步选择(或顺序替换),这是前向和后向选择的组合。从没有预测变量开始,然后依次添加最有原创 2020-06-29 10:39:10 · 6647 阅读 · 0 评论 -
R语言实现前向逐步回归(前向选择模型)
R语言实现前向逐步回归前向逐步回归原理数据导入并分组导入数据特征与标签分开存放前向逐步回归构建输出特征集合从空开始一次创建属性列表模型效果评估前向逐步回归原理前向逐步回归的过程是:遍历属性的一列子集,选择使模型效果最好的那一列属性。接着寻找与其组合效果最好的第二列属性,而不是遍历所有的两列子集。以此类推,每次遍历时,子集都包含上一次遍历得到的最优子集。这样,每次遍历都会选择一个新的属性添加到特征集合中,直至特征集合中特征个数不能再增加。数据导入并分组导入数据,将数据集抽取70%作为训练集,剩下30%原创 2020-06-29 09:55:29 · 6960 阅读 · 0 评论 -
R的randomForestSRC包做生存分析(用随机生存森林做生存分析)
用R的randomForestSRC包做生存分析用randomForestSRC做生存分析导入randomForestSRC包准备生存分析的数据构建模型,进行生存分析绘图用randomForestSRC做生存分析导入randomForestSRC包在R中的实现如如下图所示准备生存分析的数据在R中的实现如下图所示在上图中,data_express即是我们要进行生存分析的数据,数据共有411个样本。构建模型,进行生存分析在R中的实现如下图所示绘图在R中的实现如下图所示绘图结果如下原创 2020-06-27 15:51:50 · 12506 阅读 · 0 评论 -
Qiime2安装
下载Miniconda安装包并安装Qiime2安装中文帮助文档原创 2019-08-02 17:08:44 · 2008 阅读 · 4 评论 -
NCBI数据下载-sra
NIBI数据下载-sraNCBI数据下载步骤进入NCBI选择需要的数据选择需要的数据查看数据相信信息点击数据连链接,进入下载页面下载并安装SRA ToolkitNCBI数据下载步骤NCBI具有强大的功能,今天就sra数据下载为例进行简单的介绍进入NCBI百度NCBI官网,点击进入,或者直接搜索链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/选择需要的数据如下图所示,这里...原创 2019-08-01 18:08:14 · 627 阅读 · 0 评论 -
转载-LaTeX实战经验:从零开始快速入门
版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 by-sa 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。 ...转载 2019-08-28 10:00:11 · 345 阅读 · 0 评论