把训练集看作Fock矩阵
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Fock矩阵
黑榆
训练集的熵越大,携带的信息越多,找到与之匹配的权重的难度越小,迭代次数越小
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推导STO双中心动能积分的详细展开式
因此动能积分可以表达为程序在STO双中心动能积分kinetic energy integrals得到方法Tab( double R,double za,double zb, int n1,int L1 ,int m1 ,int n2 ,int L2 ,int m2 ),将R,za,zb都设为1将n<=5&&n’<=5的所有不重复的情况都算了出来。在openscad上,用同样的海星图的办法,画出所有值。最上面的是m...原创 2022-05-28 16:15:19 · 144 阅读 · 0 评论 -
推导重叠积分的详细展开式 STO overlap integrals
《量子化学》徐光宪 p545SIDI MOHAMED MEKELLECHE, ABDELLATIF BABA-AHMEDCalculation of the One-Electron Two-Center Integrals Over Slater-Type Orbitals by Means of the Ellipsoidal Coordinates Method (1996)原创 2022-05-21 16:09:58 · 870 阅读 · 0 评论 -
STO两种重叠积分算法性能比较
验算双中心重叠积分程序 2.计算重叠积分的第二种方法现在共得到了两种STO技术路线计算重叠积分的方法,这次比较这两种方法。 n l n' l' λ ζ ζ' R YAKAR, Yusuf 计算值1 计算值2 计算值1/计算...原创 2022-05-01 16:08:16 · 229 阅读 · 0 评论 -
验算gαβ函数
Analytical evaluation of two-centre Coulomb, hybrid and one-electron integrals for Slater-type orbitalsI. I. GUSEINOYMathematical Institute, University of OxfordMS. received 9th February 1970在这篇文中给出了计算混合积分的方法,其中有一个中间函数gαβ,这个函数的表达式为上次的程...原创 2022-04-11 16:09:54 · 185 阅读 · 0 评论 -
计算混合积分的一个中间函数gαβ
Analytical evaluation of two-centre Coulomb, hybrid and one-electron integrals for Slater-type orbitalsI. I. GUSEINOVMathematical Institute, University of OxfordMS. received 9th February 1970在这篇文中给出了计算混合积分的方法,其中有一个中间函数gαβ,这个函数的表达式为其中...原创 2022-04-06 16:10:04 · 407 阅读 · 0 评论 -
双中心积分计算氟化氢HF的动能和势能
<F 1s | H 1s>,<F 2s | H 1s>,<F 2p0 | H 1s>,氟化氢中有这三种情况是双中心积分,列成表格 n l n' l' λ ζ ζ' R Pople John A 计算值 参考值/计算值原创 2022-03-11 16:07:13 · 266 阅读 · 0 评论 -
STO双中心动能积分kinetic energy integrals
双中心动能积分的公式由这个公式得到一个java计算方法Tab( double R,double za,double zb, int n1,int L1 ,int m1 ,int n2 ,int L2 ,int m2 )其中R是两核之间的距离,ζ,ζ’是斯莱特规则的核电荷数,因为第三项的lb(lb+1)-nb(nb-1)因此当n-l=1时第三项为0,不必算验算这个方法,参考了YAKAR, Yusuf写于2006年的这篇文章Evaluation of Two-center One原创 2022-03-08 16:11:25 · 347 阅读 · 0 评论 -
STO双中心势能积分
势能积分的计算公式*2由公式得到两个java计算方法VabA( double R ,int zn, double za,double zb, int n1,int L1 ,int m1 ,int n2 ,int L2 ,int m2 )VabB( double R ,int zn, double za,double zb, int n1,int L1 ,int m1 ,int n2 ,int L2 ,int m2 )zn是原子核的核电荷...原创 2022-03-05 16:27:23 · 394 阅读 · 0 评论 -
验算双中心重叠积分程序
用前面得到的计算勒让德多项式系数的新方法改写了计算重叠积分的程序,这次验证这个程序的性能,主要参考了1.Approximate Molecular Orbital Theory by Pople John A., Beveridge David L. 2.Calculation of the One-Electron Two-Center Integrals Over Slater-Type Orbitals by Means of the Ellipsoidal Coordinates Meth.原创 2022-03-04 16:07:44 · 708 阅读 · 0 评论 -
蛋白质折叠的霰弹枪方法
“我们一旦使用计算机来尽可能地去拼接2.5万个嗜血杆菌基因组的全部片段时,最后得到叫做重叠群的较大碎块,该碎块由一套重叠的DNA片段组成。为了把重叠群装配成基因组,我想我们可以从几百个任意λ克隆体的两端比较序列。如果一个λ克隆体的一端与一个重叠群相匹配,另一端与另一个重叠群匹配,那我们自然就知道这两个重叠群的次序和定位了。”---全基因霰弹枪测序法[美]克雷格.文特尔_《第一推动丛书》解码生命蛋白质有一个特征的形态,与环境无关。这意味着蛋白质作为一种形态他的分类环境就是蛋白质本身。所以蛋白质的最原创 2022-02-26 16:07:04 · 279 阅读 · 0 评论 -
计算勒让德多项式系数的第二种方法
遍历u得到相应的系数,u的取值范围0≤u≤L-mJava程序public static double[] chcL1( int L ,int m ) throws IOException, ParseException, InterruptedException { double[] a1= new double[L-m+1]; double f1=0; ...原创 2022-02-23 16:08:37 · 402 阅读 · 0 评论 -
计算约化重叠积分氟化氢HF
计算F原子的(2,1,0)电子和H原子(1,0,0)电子的重叠积分F原子核外电子的角量子数不为0,这个重叠积分的计算方法为其中ζa和ζb是斯莱特规则下的核电荷数,R是两个原子核距离为1.733,α和β是斯莱特规则的核电荷数与原子核距离的乘积。式中即为约化重叠积分,表达是为其中是勒让德多项式的系数,对于F的(2,1,0)电子系数有两个,分别是0和8.H电子的系数只有1个是8式中的计算方法为代入Sab ( 2.6,1, 2, 1 , 0 ,..原创 2022-01-28 16:07:20 · 1266 阅读 · 0 评论 -
计算勒让德多项式的系数
重叠积分的计算公式计算其中的系数Clamc和Clbmd,以计算HF为例,F原子第二层电子的勒让德多项式展开因此Clm0=0;Clm1=8同样H原子电子的勒让德多项式展开因此只有1个系数Clm0=8《量子化学》徐光宪p547Approximate Molecular Orbital Theory by Pople John A., Beveridge David L. p197...原创 2022-01-16 16:08:28 · 939 阅读 · 0 评论 -
LCAOSCF自洽场氟化氢HF斯莱特函数
设椭圆坐标得到F原子的轨道是H原子的轨道是因为和斯莱特规则则z1=8.7z2=2.6z3=1R=1.733F原子的斯莱特轨道是fx1=(z1)**(1.5)*sympy.exp(-z1* R*(μ+v)/2 )*pi**(-0.5)fx2=(z2)**(2.5)*(R*(μ+v)/2 )*sympy.exp(-z2*R*(μ+v)/2)*(3*pi)**(-0.5)fx3=(z2)**(2.5)*(R/2)* μ*v...原创 2022-01-18 16:26:25 · 435 阅读 · 0 评论 -
计算重叠积分氟化氢HF
z1=8.7z2=2.6z3=1R=1.733F原子核外电子的斯莱特轨道是fx1=(z1)**(1.5)*sympy.exp(-z1* R*(μ+v)/2 )*pi**(-0.5)fx2=(z2)**(2.5)*(R*(μ+v)/2 )*sympy.exp(-z2*R*(μ+v)/2)*(3*pi)**(-0.5)fx3=(z2)**(2.5)*(R/2)* μ*v* sympy.exp(-z2*R*(μ+v)/2)*(pi)**(-0.5) #zfx4=(z2)**(2.5)*(R...原创 2022-01-26 16:07:40 · 615 阅读 · 0 评论