MPI Linux安装运行

 

1.安装：

下载源码包，mpich2-1.3.2,

依次执行./configure --disable-fortran --disable-f77  --enable-sharedlibs=gcc --enable-shared

make

make install

make clean

这样默认系统/usr/local/bin就有mpicc、mpiexec等命令了。

--enable-sharedlibs=gcc --enable-shared两个选项是生成mpi的动态库，mpicxx.so等。

2.主机ubuntu11.10,子节点fedora15.

1. mpi默然的进程管理工具已经不是mpd，而是hydra，所以不要花力气配置mpd（除非你愿意）；
2. ssh设置：主机ssh-keygen -t rsa会在home下生成.ssh文件夹, 子节点机器同样命令，然后把主机ssh文件内东西全部考入子机器ssh内，
运行： ssh 10.1.12.55 检验是否还需要密码进行子节点ssh登录
3.编写运行程序，主机和客户机需要分别编译，如果只是主机编好，拷贝到子机器，会发生子机器no　such file 的问题。即使路径什么都对。

一定要分别编译：mpicc -o show_ui show_ui.c 原因应该是linux软链接的问题

4. 集群运行
在主节点的home下配置节点清单hosts，只需要列出机器名，机器名用命令uname -n得到
kekezhou-laptop
kekezhou.fedora:3

机器名后面跟数字是指定节点开的进程个数，没有默认是1, 这样运行的时候就可以不指定-n参数

我在/etc/hosts内还配置了集群的ip和机器名。如下：
10.1.12.53 kekezhou-laptop
10.1.12.55 kekezhou.fedora

最后是运行，在home目录下：mpiexec -f hosts -n 8 ./show_ui
参数说明：hosts是配置的机器名节点清单， 8 是需要的进程个数，最后show_ui是可执行程序

附录：show_ui.c

#include <stdio.h>
#include "mpi.h"
int main(int argc, char* argv[])
{
MPI_Init(&argc, &argv);
system("xclock\n");
MPI_Finalize();
return 0;
} /* end main */ 效果图：

图1.主节点

图2.子节点