探索高效诊疗辅助利器：RT-Utils —— Python DICOM RT Struct 操作库

探索高效诊疗辅助利器：RT-Utils —— Python DICOM RT Struct 操作库

在医学影像处理领域，RT-Utils 是一个简单而强大的 Python 库，专为 DICOM RT Struct 的操作设计。它使医生和其他使用者能够方便地查看基于一系列 DICOM 图像的分割结果，包括创建、加载、修改以及合并 RT Struct 文件。现在，让我们深入了解这个项目并了解其独特之处。

项目简介

RT-Utils 提供了一个构建器类，用于创建或加载 RT Struct（放射治疗结构集）。你可以通过二进制掩模轻松添加一个或多个感兴趣区域，并将结果保存为 RT Struct 格式。此外，该库还支持将两个现有的 RT Struct 合并到一个文件中。

技术实现

RT-Utils 使用 Python 编写，并依赖于 Numpy 进行数据处理。通过提供一个直观的 API，开发人员可以快速地对 DICOM RT Struct 进行操作。例如，你可以通过输入一个二维布尔型的掩模数组来创建一个新的 ROI（感兴趣区域），并且可以设置区域的颜色和名称。

应用场景

• 医学影像诊断：利用 RT-Utils 可以快速查看和分析 DICOM 影像系列中的分割结果。
• 放射治疗规划：在制定放射治疗计划时，可以利用 RT-Utils 创建精确的结构集，以便确定辐射剂量分布。
• 研究与教学：对于医疗影像处理的研究人员和学生，这是一个理想的工具，用于演示和测试不同的分割算法。

项目特点

1. 易用性：只需几行代码即可完成 RT Struct 的创建、加载、修改等操作。
2. 灵活性：支持从头创建或加载已有 RT Struct，还能合并两个结构集。
3. 掩模到 ROI 转换：自动提取 ROI 的轮廓，方便在各种 DICOM 查看软件中显示。
4. 广泛的 Python 支持：兼容多种 Python 版本，并已上传至 PyPI，安装便捷。
5. API 敏捷性：提供了丰富的参数选项，如颜色、描述、生成算法等，允许精细控制 ROI 制作过程。

示例代码

创建新 RT Struct：

from rt_utils import RTStructBuilder

# 创建新的 RT Struct
rtstruct = RTStructBuilder.create_new(dicom_series_path="./testlocation")
rtstruct.add_roi(mask=MASK)
rtstruct.save('new-rt-struct')

加载并修改现有 RT Struct：

rtstruct = RTStructBuilder.create_from(
  dicom_series_path="./testlocation", 
  rt_struct_path="./testlocation/rt-struct.dcm"
)
rtstruct.add_roi(mask=MASK, color=[255, 0, 255], name="RT-Utils ROI!")
rtstruct.save('new-rt-struct')

结论

RT-Utils 以其简洁高效的特性，为 DICOM RT Struct 操作带来了一种全新的解决方案。无论是临床应用还是科研需求，都可以借助此库提高工作效率，减少繁琐的手动操作。立即尝试 安装 RT-Utils，开启你的 DICOM 结构集管理之旅吧！