ECG 分类使用 MIT-BIH 数据的开源项目教程
ecg-mit-bih项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ec/ecg-mit-bih
1. 项目目录结构及介绍
该项目的根目录包含了以下关键组件:
.
├── data # 储存原始MIT-BIH心电图数据
│ ├── MITDB # MIT-BIH Arrhythmia Database的数据子集
│ └── processed # 处理后的数据文件
├── models # 存储预训练模型和模型定义
│ ├── checkpoints # 存放训练完成的模型权重
│ └── model.py # 模型架构定义文件
├── scripts # 各种脚本,如数据处理和训练
│ ├── preprocess.py # 数据预处理脚本
│ ├── train.py # 训练模型的脚本
│ └── predict.py # 使用模型进行预测的脚本
├── app # Flask应用程序代码
│ ├── __init__.py # 应用程序入口
│ └── routes.py # Web服务路由定义
└── requirements.txt # 项目依赖项列表
简而言之,data
存储数据,models
用于模型管理,scripts
包含自动化任务,app
用于构建基于Flask的Web应用,而 requirements.txt
列出所有必要的Python包。
2. 项目的启动文件介绍
2.1 训练模型:scripts/train.py
这个脚本负责加载数据,初始化模型,设置训练参数并执行训练过程。你可以通过修改配置参数来调整学习率、批量大小和训练轮数等。
python scripts/train.py --data_path <path_to_data> --model_config models/model.py --output_dir models/checkpoints
2.2 预测模型:scripts/predict.py
此脚本加载预先训练好的模型并应用于新的心电图数据以进行分类。
python scripts/predict.py --input_file <path_to_input_ecg> --model_path models/checkpoints/<checkpoint_file>.hdf5
2.3 Web应用:app/routes.py
这个文件定义了Flask应用程序的路由。你可以运行 app/__init__.py
来启动Web服务,允许用户上传心电图并获取分类结果。
python app/__init__.py
3. 项目的配置文件介绍
虽然此项目没有专门的配置文件,但可以通过命令行参数来调整一些关键设置。例如,在 train.py
和 predict.py
中,你可以指定数据路径 (--data_path
),模型配置文件 (--model_config
) 以及模型检查点路径 (--model_path
)。
如果你希望添加自定义配置文件,可以在项目中创建一个新的 .yaml
或 .json
文件来存储这些参数,并相应地更新训练和预测脚本来读取它们。
请注意,为了正确运行上述命令,确保已安装所有依赖项。使用以下命令安装:
pip install -r requirements.txt
最后,确保遵循MIT-BIH数据库的许可条件,并引用相关出版物以符合学术伦理。
ecg-mit-bih项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ec/ecg-mit-bih