Juicer 开源项目使用文档

Juicer 开源项目使用文档

juicerA One-Click System for Analyzing Loop-Resolution Hi-C Experiments项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/jui/juicer

1. 项目的目录结构及介绍

Juicer 项目的目录结构如下：

juicer/
├── LICENSE
├── README.md
├── bin/
│   ├── juicer
│   └── ...
├── docs/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── scripts/
│   ├── common/
│   ├── hic-pipeline/
│   └── ...
├── src/
│   ├── c/
│   ├── java/
│   └── ...
└── tools/
    ├── juicer_tools.jar
    └── ...

目录介绍

• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目说明文档。
• bin/: 包含可执行脚本文件。
• docs/: 包含项目文档。
• scripts/: 包含各种脚本文件，用于数据处理和分析。
• src/: 包含项目的源代码，包括 C 和 Java 代码。
• tools/: 包含项目所需的各种工具，如 juicer_tools.jar。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件位于 bin/ 目录下，主要文件是 juicer。

启动文件介绍

• juicer: 这是一个主要的启动脚本，用于启动 Juicer 项目。它包含了项目的主要配置和运行逻辑。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件通常位于 scripts/ 目录下，具体配置文件可能包括：

配置文件介绍

• common/: 包含通用配置文件，如环境变量配置等。
• hic-pipeline/: 包含 Hi-C 数据处理管道的配置文件。

具体的配置文件内容和格式需要根据实际使用情况进行调整和配置。

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以上是 Juicer 开源项目的基本使用文档，希望对您有所帮助。

juicerA One-Click System for Analyzing Loop-Resolution Hi-C Experiments项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/jui/juicer