PyLabRobot 开源项目教程

PyLabRobot 开源项目教程

pylabrobot A hardware agnostic interface and developer ecosystem for lab automation 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pylabrobot

1. 项目介绍

PyLabRobot 是一个硬件无关的纯 Python 库，用于液体处理和其他实验室自动化设备的控制。它提供了一个统一的接口，支持多种液体处理机器人、板读器、泵、天平、加热振荡器等设备。PyLabRobot 旨在通过现代 Python 3.8+ 特性和异步/等待语法，实现快速开发和迭代。

主要特点

• 硬件无关: 支持多种液体处理机器人，如 Hamilton STAR、Hamilton Vantage、Tecan Freedom EVO 和 Opentrons OT-2。
• 跨平台: 支持 Windows、macOS 和 Linux。
• 开源: 免费使用，代码开源。
• 快速支持: 活跃的社区论坛，大多数 PR 在一天内合并。

2. 项目快速启动

安装

首先，确保你已经安装了 Python 3.8 或更高版本。然后使用 pip 安装 PyLabRobot：

pip install pylabrobot

快速示例

以下是一个简单的示例，展示如何使用 PyLabRobot 将 100µL 液体从 A1 孔移动到 A2 孔：

from pylabrobot.liquid_handling import LiquidHandler
from pylabrobot.resources import TubeCarrier, TubeRack, Well

# 初始化液体处理器
lh = LiquidHandler()

# 设置资源
carrier = TubeCarrier()
rack = TubeRack()
well_a1 = Well("A1")
well_a2 = Well("A2")

# 连接到机器人
lh.connect()

# 移动液体
lh.aspirate(well_a1, 100)
lh.dispense(well_a2, 100)

# 断开连接
lh.disconnect()

3. 应用案例和最佳实践

应用案例

• 高通量筛选: 使用 PyLabRobot 自动化液体处理过程，提高筛选效率。
• 药物研发: 在药物研发过程中，自动化液体处理可以减少人为错误，提高实验重现性。

最佳实践

• 模块化设计: 将复杂的液体处理任务分解为多个小模块，便于调试和维护。
• 错误处理: 在代码中加入错误处理机制，确保在出现异常时能够安全地停止操作。

4. 典型生态项目

相关项目

• PyHamilton: 专门用于 Hamilton 机器人的 Python 接口，与 PyLabRobot 互补。
• Jupyter Notebooks: 用于交互式开发和调试 PyLabRobot 代码。

社区资源

• 论坛: PyLabRobot 论坛
• 论文: PyLabRobot 论文

通过以上内容，您可以快速上手 PyLabRobot 项目，并了解其在实验室自动化中的应用和最佳实践。

pylabrobot A hardware agnostic interface and developer ecosystem for lab automation 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pylabrobot