BIDS Starter Kit 开源项目教程

BIDS Starter Kit 开源项目教程

bids-starter-kitCollection of tutorials, wikis, and templates to get you started with creating BIDS compliant datasets项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/bi/bids-starter-kit

1. 项目的目录结构及介绍

BIDS Starter Kit 项目的目录结构旨在帮助用户理解和遵循 Brain Imaging Data Structure (BIDS) 标准。以下是项目的主要目录结构及其介绍：

• .github: 包含 GitHub 相关的配置文件，如 issue 模板和 pull request 模板。
• CONTRIBUTING.md: 贡献指南，指导用户如何为项目做出贡献。
• data: 示例数据目录，包含符合 BIDS 标准的示例数据集。
• docs: 文档目录，包含项目的详细文档和教程。
• examples: 示例目录，包含如何使用 BIDS 的示例脚本和配置文件。
• LICENSE: 项目许可证文件，说明项目的使用许可。
• README.md: 项目的主 README 文件，提供项目的概览和基本使用说明。
• code: 代码目录，包含用于处理和转换数据的脚本。

2. 项目的启动文件介绍

BIDS Starter Kit 项目的启动文件主要位于 code 目录下，这些文件用于初始化项目和执行基本的数据处理任务。以下是一些关键的启动文件及其介绍：

• init_bids.py: 初始化 BIDS 项目的脚本，帮助用户设置新的 BIDS 数据集。
• process_data.py: 数据处理脚本，用于执行数据转换和预处理任务。
• validate_bids.py: BIDS 验证脚本，用于检查数据集是否符合 BIDS 标准。

3. 项目的配置文件介绍

BIDS Starter Kit 项目的配置文件主要用于设置项目的环境和参数。以下是一些关键的配置文件及其介绍：

• config.json: 主配置文件，包含项目的全局设置和参数。
• environment.yml: Conda 环境配置文件，用于设置项目的 Python 环境。
• .bidsignore: BIDS 忽略文件，指定在 BIDS 验证过程中需要忽略的文件和目录。
• .gitignore: Git 忽略文件，指定在版本控制中需要忽略的文件和目录。

以上是 BIDS Starter Kit 项目的基本教程，涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用该项目。

bids-starter-kitCollection of tutorials, wikis, and templates to get you started with creating BIDS compliant datasets项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/bi/bids-starter-kit