3D-CycleGan-Pytorch-MedImaging 项目教程

3D-CycleGan-Pytorch-MedImaging 项目教程

3D-CycleGan-Pytorch-MedImaging项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/3d/3D-CycleGan-Pytorch-MedImaging

1. 项目的目录结构及介绍

目录结构

3D-CycleGan-Pytorch-MedImaging/
├── check_loader_patches.py
├── organize_folder_structure.py
├── options_folder/
│   └── base_options.py
├── utils/
│   └── NiftiDataset.py
├── requirements.txt
├── README.md
└── LICENSE

目录介绍

• check_loader_patches.py: 显示训练期间提供给网络的补丁示例。
• organize_folder_structure.py: 组织数据为网络训练和测试的文件夹结构。
• options_folder/base_options.py: 配置选项列表。
• utils/NiftiDataset.py: 处理 Nifti 数据集的实用工具。
• requirements.txt: 项目依赖的 Python 包列表。
• README.md: 项目说明文档。
• LICENSE: 项目许可证（MIT 许可证）。

2. 项目的启动文件介绍

check_loader_patches.py

该文件用于显示训练期间提供给网络的补丁示例。以下是文件的主要内容：

import matplotlib.pyplot as plt
from utils.NiftiDataset import *
from torch.utils.data import DataLoader
import utils.NiftiDataset as NiftiDataset
import argparse

parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument("--data_path", type=str, default='/Data_folder/train/')
parser.add_argument("--resample", action='store_true', default=False, help='Decide or not to resample the images to a new resolution')
parser.add_argument("--new_resolution", type=float, default=(0.5, 0.5, 0.5), help='New resolution')

功能介绍

• 导入必要的库和模块。
• 使用 argparse 解析命令行参数。
• 定义数据路径、是否重新采样以及新分辨率等参数。

3. 项目的配置文件介绍

options_folder/base_options.py

该文件包含项目的配置选项列表。以下是文件的主要内容：

# base_options.py

class BaseOptions():
    def __init__(self):
        self.data_path = '/Data_folder/train/'
        self.resample = False
        self.new_resolution = (0.5, 0.5, 0.5)
        # 其他配置选项...

功能介绍

• 定义项目的默认配置选项。
• 包括数据路径、是否重新采样以及新分辨率等参数。

以上是 3D-CycleGan-Pytorch-MedImaging 项目的基本教程，涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些内容能帮助你更好地理解和使用该项目。

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