Zenodo-Upload: 使用CURL、JQ和Bash上传大文件到Zenodo的指南
1. 项目介绍
Zenodo-Upload 是一个简单的命令行脚本工具,它利用CURL、JQ和Bash来帮助用户方便地将大型文件上传至Zenodo.org。这个开源项目由jhpoelen创建,旨在简化通过Zenodo API进行大文件上传的过程。Zenodo是一个开放存档平台,可以长期存储并为你的科研成果提供DOI(数字对象标识符)。
2. 项目快速启动
安装前提条件
- CURL: 用于发送HTTP请求。
- JQ: 用于解析JSON数据。
- Bash: 脚本运行环境。
确保你的系统已经安装了这些工具。
克隆仓库并设置访问令牌
在终端中执行以下命令:
git clone https://github.com/jhpoelen/zenodo-upload.git
cd zenodo-upload
export ZENODO_TOKEN=[Zenodo访问令牌]
请将[Zenodo访问令牌]
替换为你在Zenodo账户设置中创建的新API令牌。
创建并上传文件
-
首先,在Zenodo的Web界面创建一个新的出版物记录,输入标题等基本信息,然后保存。
-
复制沉积ID(例如
https://zenodo.org/deposit/12345
中的12345
)。 -
在终端中执行以下命令上传文件:
./zenodo_upload.sh [沉积ID] [文件名] --verbose
--verbose
选项可选,用于查看更详细的上传过程。
查看结果
成功上传后,刷新Zenodo页面,你应该能看到文件已添加到新创建的记录中。
3. 应用案例和最佳实践
案例一:团队协作时,可以使用Zenodo-Upload自动将研究成果上传到共享的Zenodo存储库,方便团队成员间同步。
最佳实践:
- 确保每次上传前检查Zenodo Token的有效性。
- 对大型数据集或软件包进行版本控制,为每个版本创建新的Zenodo记录。
- 在发布重要更新之前,预览和确认所有元数据的准确性。
4. 典型生态项目
Zenodo-Upload作为命令行工具,常与其他研究工作流程集成,如GitLab CI/CD管道,用于自动上传每次提交后的软件包或数据。此外,它也可以与学术写作工具,如Jupyter Notebook结合,实现研究成果一键上传。
以上就是Zenodo-Upload的基本使用教程,希望对你在管理和分享大型科研数据上有所帮助。如有更多疑问,请参考项目仓库的Readme文件或向开发者社区寻求帮助。