RXNFP 项目使用教程

RXNFP 项目使用教程

rxnfp Reaction fingerprints, atlases and classification. Code complementing our Nature Machine Intelligence publication on "Mapping the space of chemical reactions using attention-based neural networks" (http://rdcu.be/cenmd). 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/rx/rxnfp

1. 项目目录结构及介绍

RXNFP 项目的目录结构如下：

rxnfp/
├── data/
├── docs/
├── nbs/
├── rxnfp/
├── .gitignore
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
├── Makefile
├── README.md
├── settings.ini
└── setup.py

目录介绍：

• data/: 存放项目所需的数据文件。
• docs/: 存放项目的文档文件。
• nbs/: 存放 Jupyter Notebook 文件，通常用于演示和教程。
• rxnfp/: 项目的主要代码文件夹，包含生成化学反应指纹的核心代码。
• .gitignore: Git 忽略文件，指定哪些文件或目录不需要被版本控制。
• CONTRIBUTING.md: 贡献指南，指导开发者如何为项目贡献代码。
• LICENSE: 项目许可证文件，通常为 MIT 许可证。
• MANIFEST.in: 用于指定在打包时需要包含的文件。
• Makefile: 用于自动化构建和测试的 Makefile 文件。
• README.md: 项目介绍文件，通常包含项目的概述、安装和使用说明。
• settings.ini: 项目的配置文件，用于设置项目的各种参数。
• setup.py: Python 项目的安装脚本，用于安装项目的依赖和打包项目。

2. 项目启动文件介绍

RXNFP 项目的启动文件主要是 setup.py 和 README.md。

setup.py

setup.py 是 Python 项目的标准安装脚本，用于安装项目的依赖和打包项目。通过运行以下命令可以安装项目：

pip install -e .

README.md

README.md 是项目的介绍文件，包含了项目的概述、安装和使用说明。开发者可以通过阅读 README.md 快速了解项目的基本信息和使用方法。

3. 项目的配置文件介绍

RXNFP 项目的配置文件是 settings.ini，该文件用于设置项目的各种参数。

settings.ini

settings.ini 文件的内容如下：

[DEFAULT]
host = github
lib_name = rxnfp

配置项介绍：

• host: 指定项目的主机地址，通常为 GitHub。
• lib_name: 指定项目的库名称，这里是 rxnfp。

通过修改 settings.ini 文件中的配置项，可以调整项目的运行环境和参数设置。

rxnfp Reaction fingerprints, atlases and classification. Code complementing our Nature Machine Intelligence publication on "Mapping the space of chemical reactions using attention-based neural networks" (http://rdcu.be/cenmd). 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/rx/rxnfp