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R语言基础练习与入门实践

  练习: 熟练使用R软件 实践1:最初几步 x=1:100#把1,2,...,100个整数向量赋值到x (x=1:100) #同上, 只不过显示出来 sample(x,20) #从1,...,100中随机不放回地抽取20个值作为样本 set.seed(0);sample(1:10,3)#...

2019-01-16 19:26:40

阅读数 19

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R语言读取CSV文件

#读取CSV文件 data <- read.csv("drugbank.csv", header = FALSE)      

2019-01-06 14:47:11

阅读数 34

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漂亮的四叶草

  /****************************************************************** *Copyright (C),2018-2019 *File Name :漂亮的四叶草 *Project Name :Fou...

2019-01-04 20:04:18

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R语言-路径设置与工作目录修改

R语言中的路径设置 软件的路径设置对于电脑的内存管理、工作数据的保存和自己的寻根究底十分重要。所以,合理的设置R中相关路径,能更加方便快捷的管理自己的相关文件,提高学习R语言的效率,建立自己的习惯体系。 R中的路径设置主要有以下几个方面: 工作目录的路径 安装包的路径 工作目录 1.使用...

2019-01-01 19:42:10

阅读数 50

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R语言-包的安装、载入及使用方法

一、原理简述 包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。计算机上存储包的目录称为库(library)。函数.libPaths()能够显示库所在的位置,函数library()则可以显示库中有哪些包。 R自带了一系列默认包(包括base、datasets、utils、grDe...

2019-01-01 18:19:49

阅读数 814

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R语言-安装使用指南

  R语言 概述 R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境。 R语言由Ross Ihaka和Robert Gentleman在新西兰奥克兰大学创建,目前由R语言开发核心团队开发。 R语言的核心是解释计算机语言,其允许分支和循环以及使用函数的模块化编程。 R语言允许与以C,C ...

2019-01-01 05:02:16

阅读数 20

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Centos 7.5安装配置MongoDB 4.0.5

MongoDB是一个基于分布式文件存储的数据库。由C++语言编写。旨在为WEB应用提供可扩展的高性能数据存储解决方案。 MongoDB是一个介于关系数据库和非关系数据库之间的产品,是非关系数据库当中功能最丰富,最像关系数据库的。他支持的数据结构非常松散,是类似json的bson格式,因此可以存储...

2019-01-01 05:01:59

阅读数 51

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MySQL常用命令行大全

    登陆 mysql -u root -p 创建数据库 create database Genebank; 显示数据库 show databases; 删除数据库 drop database Genebank; 连接数据库 use Drugba...

2019-01-01 05:01:41

阅读数 13

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Python 3 —— 使用 PyMySQL 操作 MySQL8

  PyMySQL 是一个纯 Python 实现的 MySQL 客户端操作库,支持事务、存储过程、批量执行等。 PyMySQL 遵循 Python 数据库 API v2.0 规范,并包含了 pure-Python MySQL 客户端库。 pip install PyMySQL 创建数据库...

2019-01-01 05:01:27

阅读数 50

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Navicat 12连接MySQL8服务器

  测试连接    

2018-12-14 22:43:15

阅读数 37

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CentOS7.5下yum安装MySQL8图文教程

  卸载MariaDB 1.列出所有安装的MariaDB rpm 包 rpm -qa | grep mariadb 2.强制卸载 rpm -e --nodeps mariadb-libs-5.5.60-1.el7_5.x86_64 安装MySQL 1. 环境 CentOS7...

2018-12-14 22:10:58

阅读数 35

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RDKit支持PostgreSQL配置

  安装RDKit的PostgreSQL支持 conda install -c rdkit rdkit-postgresql 安装psycopg2,是Python语言的PostgreSQL数据库接口 pip install psycopg2 为drugbank数据库创建扩展: p...

2018-12-09 11:17:50

阅读数 63

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生物信息学数据库分类概览

生物与计算机的结合让生物进入大数据时代,为方便管理各种生物数据,科学家们开发了各式各样的生物数据库。了解与自己研究领域相关的数据库,并加以利用可能会使研究工作得到事半功倍的效果。在此将常用数据库按照以下分类方式大致整理了一下,也方便检索。 1. Meta databases 元数据库,合并不同...

2018-11-24 18:55:07

阅读数 159

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CentOS7.5安装配置PostgreSQL10

  CentOS系统中安装postgresql的rpm源: yum install https://download.postgresql.org/pub/repos/yum/10/redhat/rhel-7-x86_64/pgdg-centos10-10-2.noarch.rpm ...

2018-11-18 23:04:55

阅读数 36

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Windows10+Python3.6(Anaconda3)+OpenCV3.4安装配置

  环境 win10(64bit)+Anaconda3(python3.6.5) 下载opencv_python 执行下面命令安装opencv3.4.3: pip install opencv_python-3.4.3-cp36-cp36m-win_amd64.whl 测试 ...

2018-11-11 20:34:52

阅读数 77

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Windows10下Python3做OpenGL的编程

  OpenGL的Python3.6环境配置 下载: PyOpenGL‑3.1.3b2‑cp36‑cp36m‑win_amd64.whl PyOpenGL_accelerate‑3.1.3b2‑cp36‑cp36m‑win_amd64.whl 安装: #pip install wh...

2018-11-11 19:21:50

阅读数 57

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基于随机森林的化合物活性二分类模型

    #导入依赖包 import pandas as pd import numpy as np from rdkit import Chem, DataStructs from rdkit.Chem import AllChem from rdkit.ML.Descriptors imp...

2018-11-07 20:12:41

阅读数 102

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基于RDKit探索DrugBank

如题:仅供参考   #导入依赖包 #!/usr/bin/python3 from rdkit import Chem from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole from rdkit.Chem import AllChem from rdkit i...

2018-10-06 22:26:41

阅读数 288

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基于神经网络的溶解度预测和回归分析

人工智能是一个主题,尝试使用神经网络作为模型建立化合物物理性质的预测模型。机器学习库是由Google开发和使用的TensorFlow。Keras是一个使TensorFlow的神经网络功能更易于使用的软件包。 <数据集文件见:https://download.csdn.net...

2018-09-16 17:04:08

阅读数 373

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RDKit:化合物亚结构(Substructure)搜索(基于Python3)

  代码示例: #导入依赖包 #!/usr/bin/python3 from rdkit.Chem import AllChem as ch from rdkit.Chem import Draw as d #载入分子库 suppl = ch.SDMolSupplier('drugb...

2018-09-12 18:23:16

阅读数 363

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