Shournal 项目安装与使用教程
1. 项目目录结构及介绍
Shournal 项目的目录结构如下:
shournal/
├── bin/
│ ├── shournal
│ └── shournal-to-snakemake
├── config/
│ ├── shournal.conf
│ └── kgroup
├── docs/
│ ├── README.md
│ └── compile-README
├── src/
│ ├── main.c
│ ├── config.c
│ └── utils.c
├── tests/
│ ├── test_main.sh
│ └── test_config.sh
└── README.md
目录介绍
- bin/: 包含 Shournal 的可执行文件,如
shournal
和shournal-to-snakemake
。 - config/: 包含项目的配置文件,如
shournal.conf
和kgroup
。 - docs/: 包含项目的文档文件,如
README.md
和compile-README
。 - src/: 包含项目的源代码文件,如
main.c
,config.c
, 和utils.c
。 - tests/: 包含项目的测试脚本,如
test_main.sh
和test_config.sh
。 - README.md: 项目的总体介绍文件。
2. 项目启动文件介绍
Shournal 项目的启动文件是 bin/shournal
。该文件是 Shournal 的主要可执行文件,用于监控和记录 shell 命令的执行情况。
启动文件功能
- 监控命令: 记录所有在 shell 中执行的命令及其相关文件操作。
- 查询命令: 通过
shournal --query
命令查询特定文件的操作记录。 - 转换为 Snakemake 规则: 通过
shournal-to-snakemake
将记录的命令转换为 Snakemake 工作流规则。
3. 项目配置文件介绍
Shournal 项目的配置文件主要位于 config/
目录下,包括 shournal.conf
和 kgroup
。
配置文件介绍
- shournal.conf: 这是 Shournal 的主配置文件,用于配置监控的行为,如是否记录读取的文件、是否启用 shell 集成等。
- kgroup: 该文件用于配置 Shournal 的内核模块组,通常在需要自定义内核模块行为时使用。
配置文件示例
# shournal.conf 示例
[General]
enable_shell_integration = true
log_read_files = true
[KGroup]
group_name = default
通过这些配置文件,用户可以根据自己的需求定制 Shournal 的行为,以满足不同的监控和记录需求。