PEGAS 开源项目安装与使用指南

PEGAS 开源项目安装与使用指南

PEGAS Powered Explicit Guidance Ascent System - a KSP & RO autopilot using the Space Shuttle guidance algorithm, UPFG 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pe/PEGAS

一、项目目录结构及介绍

欢迎使用 PEGAS（Population and Evolutionary Genetics Analysis System）——一个专用于分析群体遗传数据的R包。请注意，您提供的链接似乎不正确或已更改，因为基于提供的描述，正确的仓库地址应该是 https://github.com/emmanuelparadis/pegas 而非 https://github.com/Noiredd/PEGAS.git。我们将基于正确的仓库地址提供指导。

PEGAS 的项目结构大致如下：

• pegas/: 包含了开发中的代码，即下一版本准备发布到CRAN的内容。
• LICENSE: 许可证文件，表明该项目遵循GPL-2.0许可协议。
• gitignore: 指定了Git在提交时不包括特定文件或目录的列表。
• README.md: 项目的主要说明文件，包含了关于PEGAS的基本信息，如访问网址、简介等。
• 其他文档：可能包括更详细的用户手册或者示例，通常位于项目网站或在线文档中。

二、项目启动文件介绍

对于R包，启动通常意味着加载该包到当前的R会话中。在R环境中，启动PEGAS包的操作非常简单，通过以下命令即可完成：

library(pegas)

实际上，并没有单独的“启动文件”需要手动执行，R包通过这种方式被激活使用其功能。

三、项目的配置文件介绍

PEGAS作为一个R包，并不像一些服务器端应用那样需要特定的本地配置文件来定义行为。其配置主要通过R语言本身的环境变量、函数参数或者工作目录等控制。例如，数据路径、输出格式等可以通过调用相应的函数时指定参数来个性化设置。

如果您想要自定义一些全局设置，可能会涉及到R的工作空间设置或是利用.Renviron或.Rprofile文件来设置环境变量，但这并不特定于PEGAS包，而是R环境的一般配置方法。

示例：使用环境变量

在.Renviron文件中添加环境变量：

PEGAS_DATA_PATH=/path/to/your/data

然后在R会话中，您可以这样使用这些变量（虽然这例子是通用的，而非PEGAS特有）：

data_path <- Sys.getenv("PEGAS_DATA_PATH")

总结来说，PEGAS的使用更多依赖于R脚本和库函数的调用来进行定制，而不是传统的配置文件方式管理。

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由于实际的项目详细结构和文件内容依赖于仓库的具体状态，上述内容是基于一般性理解的概述，具体细节可能需参照仓库最新文档或直接在R环境中查阅包的帮助文档。

PEGAS Powered Explicit Guidance Ascent System - a KSP & RO autopilot using the Space Shuttle guidance algorithm, UPFG 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pe/PEGAS