MDTraj 开源项目教程

MDTraj 开源项目教程

mdtrajAn open library for the analysis of molecular dynamics trajectories项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/md/mdtraj

1. 项目的目录结构及介绍

MDTraj 项目的目录结构如下：

mdtraj/
├── docs/
├── examples/
├── mdtraj/
│   ├── core/
│   ├── formats/
│   ├── geometry/
│   ├── io/
│   ├── testing/
│   ├── topology/
│   ├── utils/
│   └── __init__.py
├── scripts/
├── tests/
├── .gitignore
├── .travis.yml
├── AUTHORS.md
├── CHANGELOG.md
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
├── README.md
├── setup.cfg
├── setup.py
└── tox.ini

目录介绍：

• docs/: 包含项目的文档文件。
• examples/: 包含示例代码和数据。
• mdtraj/: 核心代码目录，包含各种模块和功能。
  • core/: 核心功能模块。
  • formats/: 文件格式处理模块。
  • geometry/: 几何计算模块。
  • io/: 输入输出模块。
  • testing/: 测试模块。
  • topology/: 拓扑结构处理模块。
  • utils/: 工具模块。
  • __init__.py: 初始化文件。
• scripts/: 包含一些脚本文件。
• tests/: 包含测试文件。
• .gitignore: Git 忽略文件配置。
• .travis.yml: Travis CI 配置文件。
• AUTHORS.md: 作者列表。
• CHANGELOG.md: 变更日志。
• CONTRIBUTING.md: 贡献指南。
• LICENSE: 许可证文件。
• MANIFEST.in: 清单文件。
• README.md: 项目说明文件。
• setup.cfg: 安装配置文件。
• setup.py: 安装脚本。
• tox.ini: Tox 配置文件。

2. 项目的启动文件介绍

MDTraj 项目的启动文件主要是 setup.py，它负责项目的安装和配置。通过运行 python setup.py install 可以安装 MDTraj 库。

3. 项目的配置文件介绍

MDTraj 项目的配置文件主要包括：

• setup.cfg: 包含安装和打包的配置信息。
• tox.ini: 用于配置 Tox 自动化测试环境。
• .travis.yml: 用于配置 Travis CI 持续集成环境。

这些配置文件确保了项目的正确安装、测试和持续集成。

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以上是 MDTraj 开源项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这份教程能帮助你更好地理解和使用 MDTraj 项目。

mdtrajAn open library for the analysis of molecular dynamics trajectories项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/md/mdtraj