3D NIfTI 可视化器项目教程

3D NIfTI 可视化器项目教程

3d-nii-visualizerA NIfTI (nii.gz) 3D Visualizer using VTK and Qt5项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/3d/3d-nii-visualizer

1. 项目的目录结构及介绍

目录结构

3d-nii-visualizer/
├── README.md
├── requirements.txt
├── setup.py
├── src/
│   ├── main.py
│   ├── config.py
│   ├── utils/
│   │   ├── nifti_loader.py
│   │   ├── vtk_renderer.py
│   ├── data/
│   │   ├── sample.nii.gz
├── tests/
│   ├── test_nifti_loader.py
│   ├── test_vtk_renderer.py

目录介绍

• README.md: 项目说明文件，包含项目的基本信息和使用指南。
• requirements.txt: 项目依赖文件，列出了运行项目所需的Python包。
• setup.py: 项目安装脚本，用于安装项目及其依赖。
• src/: 源代码目录，包含项目的所有源代码文件。
  • main.py: 项目的主启动文件。
  • config.py: 项目的配置文件。
  • utils/: 工具函数目录，包含加载NIfTI文件和渲染VTK视图的工具函数。
    • nifti_loader.py: 加载NIfTI文件的工具函数。
    • vtk_renderer.py: 渲染VTK视图的工具函数。
  • data/: 数据目录，包含示例NIfTI文件。
• tests/: 测试目录，包含项目的单元测试文件。
  • test_nifti_loader.py: 测试NIfTI文件加载功能的单元测试。
  • test_vtk_renderer.py: 测试VTK视图渲染功能的单元测试。

2. 项目的启动文件介绍

main.py

main.py 是项目的启动文件，负责初始化配置、加载NIfTI文件并启动VTK可视化界面。以下是 main.py 的主要功能：

import sys
from config import Config
from utils.nifti_loader import load_nifti
from utils.vtk_renderer import VtkRenderer

def main():
    # 加载配置
    config = Config()
    
    # 加载NIfTI文件
    nifti_file = config.nifti_file
    data, affine = load_nifti(nifti_file)
    
    # 初始化VTK渲染器
    renderer = VtkRenderer(data, affine)
    renderer.start()

if __name__ == "__main__":
    main()

功能介绍

• 加载配置: 从 config.py 中加载项目配置。
• 加载NIfTI文件: 使用 nifti_loader.py 中的 load_nifti 函数加载NIfTI文件。
• 初始化VTK渲染器: 使用 vtk_renderer.py 中的 VtkRenderer 类初始化VTK渲染器并启动可视化界面。

3. 项目的配置文件介绍

config.py

config.py 是项目的配置文件，包含项目的各种配置参数。以下是 config.py 的主要内容：

class Config:
    def __init__(self):
        self.nifti_file = "src/data/sample.nii.gz"
        self.window_size = (800, 600)
        self.background_color = (0.1, 0.1, 0.1)
        self.opacity = 0.8

配置参数介绍

• nifti_file: NIfTI文件路径，指定要加载的NIfTI文件。
• window_size: 可视化窗口的大小，以像素为单位。
• background_color: 可视化窗口的背景颜色，以RGB值表示。
• opacity: 可视化图像的不透明度，取值范围为0到1。

以上是 3d-nii-visualizer 项目的教程，包含了项目的目录结构、启动文件和配置文件的详细介绍。希望这些内容能帮助你更好地理解和使用该项目。

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